RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BQ85 93 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BUA1 57 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf74Q96GX8 76 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-3P60369 221 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 PRO0255Q9UI72 69 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 NOTCH1P46531 2555 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.01□□□□□ -1.77
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RABGEF1-202ENST00000380828 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JQZ4 141 aa4□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PNN7 141 aa4□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 COX17Q14061 63 aa4□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N377 158 aa3.99□□□□□ -1.77
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RABGEF1-202ENST00000380828 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.97□□□□□ -1.77
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RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM168BA1KXE4 195 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 TPRXLQ17RH7 258 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINK1P00995 79 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV7-43P04211 117 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 LELP1Q5T871 98 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 COL6A5A8TX70 2615 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZRX8 168 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GUV1 79 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 H0YAA0 97 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 MYCBP2O75592 4640 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 PRLHP81277 87 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 ACYP2P14621 99 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N1X5 172 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 STAB1Q9NY15 2570 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EIL1 84 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-11P60412 298 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH2Q9P225 4427 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 PKHD1P08F94 4074 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-202ENST00000380828 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFL1Q6UW32 110 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-8P60410 259 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 RYR2Q92736 4967 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZSA8 131 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GU33 70 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2-30P06310 120 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 RYR3Q15413 4870 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1-202ENST00000380828 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.78□□□□□ -1.8
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.78□□□□□ -1.8
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RABGEF1-202ENST00000380828 C14orf177Q52M58 125 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1-202ENST00000380828 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-202ENST00000380828 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRR1AP35321 89 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-202ENST00000380828 R4GN34 69 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.74□□□□□ -1.81
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RABGEF1-202ENST00000380828 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-202ENST00000380828 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.69□□□□□ -1.82
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RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 PKD1P98161 4303 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 TGP01266 2768 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 HERC2O95714 4834 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 TENM3Q9P273 2699 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 APLNQ9ULZ1 77 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GVY2 172 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0D9SG42 100 aa3.61□□□□□ -1.83
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