RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 ITPR3Q14573 2671 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 RYR1P21817 5038 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 ERVK-7P63135 1459 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 FCER1GP30273 86 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 RELNP78509 3460 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 ACACBO00763 2458 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 TNP1P09430 55 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCC1P33527 1531 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 MED14O60244 1454 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 LAMA3Q16787 3333 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIF1AQ12756 1690 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 CEP290O15078 2479 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 DIP2AQ14689 1571 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 H3BUA1 57 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 SMARCA2P51531 1590 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATXN8Q156A1 80 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-534P-201ENST00000364877 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCC6O95255 1503 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 LY75O60449 1722 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 MT1XP80297 61 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 COL12A1Q99715 3063 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 NEBP20929 6669 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 BPTFQ12830 3046 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 RYR3Q15413 4870 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-534P-201ENST00000364877 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCA8O94911 1581 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 M0QY20 66 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 MT1EP04732 61 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABRACLQ9P1F3 81 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 M0R1W7 72 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 RYR2Q92736 4967 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 M0QZ58 72 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 MT1LQ93083 61 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 C3P01024 1663 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-534P-201ENST00000364877 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms