RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PDE6GP18545 87 aa4.22□□□□□ -1.73
SGMS1-201ENST00000361543 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JQZ4 141 aa4.21□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.21□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.21□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GW54 56 aa4.2□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf92A6NGG3 77 aa4.2□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 H3BT86 120 aa4.2□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.2□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 C9JAW5 83 aa4.19□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 CCKP06307 115 aa4.19□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf195Q5TG92 126 aa4.19□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WSZ3 146 aa4.18□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.18□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.18□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.17□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.16□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GV72 72 aa4.16□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PNM2 257 aa4.16□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.16□□□□□ -1.74
SGMS1-201ENST00000361543 PCOTHQ58A44 107 aa4.15□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 VPS25Q9BRG1 176 aa4.15□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 K7EP34 96 aa4.14□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.14□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.14□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 J3KT08 172 aa4.13□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZQT0 140 aa4.13□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 SIGMAR1Q99720 223 aa4.12□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.11□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 F8W1H4 67 aa4.1□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV4-1P06312 121 aa4.1□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 PRO0461Q9UI25 63 aa4.1□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB1O75438 58 aa4.09□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 MTURNQ8N3F0 131 aa4.09□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.09□□□□□ -1.75
SGMS1-201ENST00000361543 NREPQ16612 68 aa4.08□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.08□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 Q96NJ1 140 aa4.08□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf87E5RJ46 101 aa4.07□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.07□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00313P59037 77 aa4.06□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 Q75L30 129 aa4.06□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GVX0 72 aa4.05□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 MT1HP80294 61 aa4.05□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.05□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.04□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 A8MWP4 228 aa4.04□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 UBL5Q9BZL1 73 aa4.04□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.03□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.03□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.03□□□□□ -1.76
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GV90 55 aa4.02□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 A8MUU9 505 aa4.02□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 BPY2O14599 106 aa4.02□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 DSCR10P59022 87 aa4.02□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 ETDBQ3ZM63 59 aa4.01□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 ACYP1P07311 99 aa4□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 PRR15Q8IV56 129 aa4□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZVQ6 151 aa3.99□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.98□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 M0R2T5 61 aa3.98□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.98□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.97□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.97□□□□□ -1.77
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.96□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.96□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00846Q9NV44 126 aa3.96□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 hDV103S1A0JD37 113 aa3.95□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 J3QR89 54 aa3.95□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL6P80162 114 aa3.95□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 K7EQZ3 153 aa3.94□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.94□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.94□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.93□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS5O43920 106 aa3.91□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.91□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 CASC2Q6XLA1 102 aa3.91□□□□□ -1.78
SGMS1-201ENST00000361543 HCG22E2RYF7 251 aa3.9□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N9L7 120 aa3.89□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00643Q86TS7 51 aa3.88□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.88□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.88□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.87□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 FAM236CP0DP71 79 aa3.87□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.87□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 HRES1P13985 223 aa3.86□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 K7ERU9 68 aa3.84□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK7P58062 85 aa3.84□□□□□ -1.79
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2-30P06310 120 aa3.83□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.83□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.79□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 USH2AO75445 5202 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms