RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 VAMP8Q9BV40 100 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00575Q6W349 94 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WSZ3 146 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TAX1BP3O14907 124 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 BATFQ16520 125 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf47Q569G3 176 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NN06 94 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BUT2 72 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf79P0CE67 100 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD52Q0P140 79 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA45Q537H7 98 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.76□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QR89 54 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EP34 96 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV4-1P06312 121 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01545Q5VT33 79 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK7P58062 85 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf87E5RJ46 101 aa3.71□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.71□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf118A6NHY6 69 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BMG7 143 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 DSCR8Q96T75 97 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PNM2 257 aa3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-9P26371 169 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB37Q96AX2 223 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 F8W1H4 67 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YGX0 51 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPM0 123 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP2P12104 132 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTDAPP60985 99 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 Q5VV11 94 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GX51 115 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVX0 72 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BQ85 93 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 TRACP01848 142 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 COX8AP10176 69 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 J3KT08 172 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFB1O75438 58 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 IMUPQ9GZP8 106 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 PRO0461Q9UI25 63 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAL4O96015 105 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-ATP8P03928 68 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 CCKP06307 115 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H4GQ99525 98 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 HIGD1BQ9P298 99 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC179H3BU77 68 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-5P60370 271 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 ATOH7Q8N100 152 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR2EP22531 72 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR2BP35325 72 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR2AP35326 72 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 ETDBQ3ZM63 59 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 C9JAW5 83 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1BP07438 61 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC61GP60059 68 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT2DO14686 5537 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 PRO0628Q9UI54 55 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0B4J2C4 111 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.52□□□□□ -1.85
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