RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RYR1P21817 5038 aa5.5□□□□□ -1.53
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RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK2AP2O75956 126 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MUN3 132 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGEF1-201ENST00000284957 Q96NJ1 140 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGEF1-201ENST00000284957 CD164Q04900 197 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGEF1-201ENST00000284957 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
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RABGEF1-201ENST00000284957 LIMD2Q9BT23 127 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GVX0 72 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-201ENST00000284957 A6NN06 94 aa5.14□□□□□ -1.59
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RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGEF1-201ENST00000284957 Q75L30 129 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BPC8 53 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-201ENST00000284957 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MUU9 505 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-201ENST00000284957 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-201ENST00000284957 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-201ENST00000284957 LPAP08519 4548 aa5.02□□□□□ -1.61
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