RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.84□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 Q8NDZ9 215 aa6.84□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.83□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.83□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.83□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.82□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZQY7 126 aa6.82□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.82□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 TMEM258P61165 79 aa6.81□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.81□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.81□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.81□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.79□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.79□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.78□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 PRYO14603 147 aa6.78□□□□□ -1.32
SPC25-201ENST00000282074 SVIPQ8NHG7 77 aa6.77□□□□□ -1.33
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SPC25-201ENST00000282074 Q6ZVQ6 151 aa6.76□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.76□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.75□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.75□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 SPRR1AP35321 89 aa6.75□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 ERC2-IT1O76042 136 aa6.73□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 J3KT08 172 aa6.72□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
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SPC25-201ENST00000282074 Q6ZRX8 168 aa6.71□□□□□ -1.33
SPC25-201ENST00000282074 SPINK1P00995 79 aa6.7□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 KLKP1Q107X0 134 aa6.7□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 A0A087WVE0 104 aa6.69□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.69□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 MT1HP80294 61 aa6.69□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 Q8NBF4 154 aa6.69□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 SPRR4Q96PI1 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.66□□□□□ -1.34
SPC25-201ENST00000282074 NREPQ16612 68 aa6.65□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 Q8N377 158 aa6.65□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.64□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.62□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 M0R2T5 61 aa6.6□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 BPY2O14599 106 aa6.6□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 Q9BRP9 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SPC25-201ENST00000282074 IGKV4-1P06312 121 aa6.58□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.58□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 C20orf197Q8N268 126 aa6.58□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.57□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 H7BZZ5 65 aa6.57□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 FAM236CP0DP71 79 aa6.57□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.57□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 F8WEM9 126 aa6.57□□□□□ -1.36
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SPC25-201ENST00000282074 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.56□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.55□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PNM2 257 aa6.55□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
SPC25-201ENST00000282074 SMIM29Q86T20 159 aa6.52□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.52□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.5□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 C5orf47Q569G3 176 aa6.48□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.47□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.47□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 C9orf92A6NGG3 77 aa6.46□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 H3BPC8 53 aa6.46□□□□□ -1.37
SPC25-201ENST00000282074 DSCR10P59022 87 aa6.46□□□□□ -1.37
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SPC25-201ENST00000282074 SSPOA2VEC9 5147 aa6.45□□□□□ -1.38
SPC25-201ENST00000282074 IGFL1Q6UW32 110 aa6.45□□□□□ -1.38
SPC25-201ENST00000282074 NDUFB1O75438 58 aa6.44□□□□□ -1.38
SPC25-201ENST00000282074 HCG22E2RYF7 251 aa6.44□□□□□ -1.38
SPC25-201ENST00000282074 LIMD2Q9BT23 127 aa6.44□□□□□ -1.38
SPC25-201ENST00000282074 SNURFQ9Y675 71 aa6.43□□□□□ -1.38
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SPC25-201ENST00000282074 Q8N9L7 120 aa6.41□□□□□ -1.38
SPC25-201ENST00000282074 Q5XG85 94 aa6.4□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 A8MWP4 228 aa6.38□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 K7EQZ3 153 aa6.38□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 MP68P56378 58 aa6.37□□□□□ -1.39
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SPC25-201ENST00000282074 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.37□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.37□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 A0A087WSZ3 146 aa6.36□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.36□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 hDV103S1A0JD37 113 aa6.35□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.35□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SPC25-201ENST00000282074 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.32□□□□□ -1.4
SPC25-201ENST00000282074 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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