RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defa5P28312 93 aa0.46□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cd28P31041 218 aa0.46□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dynlt1P51807 113 aa0.46□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Btg2Q04211 158 aa0.46□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnase2aQ8K196 155 aa0.46□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Derl3Q9D8K3 228 aa0.46□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rusc2Q80U22 1514 aa0.46□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 LctF8VPT3 1931 aa0.46□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm6034E9Q101 117 aa0.45□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm21244J3QK38 227 aa0.45□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znf106O88466 1888 aa0.45□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Plxna3P70208 1872 aa0.45□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SetxA2AKX3 2646 aa0.44□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm12169F2Z474 250 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PipP02816 146 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dynlrb1P62627 96 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rhox4gQ2MDF7 205 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vma21Q78T54 101 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1204Q7TR10 309 aa0.44□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa0.44□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defa26Q3L180 93 aa0.43□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10604Q3V0X7 143 aa0.43□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Xlr5cQ9JJR2 179 aa0.43□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Soga1E1U8D0 1418 aa0.43□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ncoa1P70365 1447 aa0.43□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ankrd12G5E893 2041 aa0.43□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mia3Q8BI84 1930 aa0.42□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa0.42□□□□□ -2.34
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Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mup15A9R9W0 180 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vsig4F6TUL9 280 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm20695H3BLK7 282 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr906K7N5P3 311 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MbpP04370 250 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pde6gP09174 87 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pcbd1P61458 104 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ccdc160Q3UYG1 323 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Smr3aQ61900 147 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q80W69 301 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vstm2aQ8R0A6 236 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tomm6Q9CQN3 74 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q9CR34 168 aa0.42□□□□□ -2.34
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa0.42□□□□□ -2.34
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