RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 NF1P21359 2839 aa-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 USH2AO75445 5202 aa-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BNG1 76 aa-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00158P58513 81 aa-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 ZZEF1O43149 2961 aa-0.5□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 H0YAA0 97 aa-0.5□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.5□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.5□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 DEPDC5O75140 1603 aa-0.5□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 HIVEP1P15822 2718 aa-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 IFI6P09912 130 aa-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 GNG2P59768 71 aa-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 FAT1Q14517 4588 aa-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.51□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 ITSN1Q15811 1721 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 MED14O60244 1454 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 LCE6AA0A183 80 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFA4O00483 81 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 NREPQ16612 68 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.52□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 MUC17Q685J3 4493 aa-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 C3orf79P0CE67 100 aa-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 HERC2O95714 4834 aa-0.53□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 ERVK-7P63135 1459 aa-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 TJP1Q07157 1748 aa-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 ST20Q9HBF5 79 aa-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A087WXM4 84 aa-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.55□□□□□ -2.5
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SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 TACC2O95359 2948 aa-0.55□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.56□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BUT2 72 aa-0.56□□□□□ -2.5
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SPTAN1-232ENST00000636483 IAPPP10997 89 aa-0.56□□□□□ -2.5
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SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.56□□□□□ -2.5
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SPTAN1-232ENST00000636483 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1AP04731 61 aa-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCC1P33527 1531 aa-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 S100A13Q99584 98 aa-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 ITPR3Q14573 2671 aa-0.6□□□□□ -2.5
SPTAN1-232ENST00000636483 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 PRLHP81277 87 aa-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 S4R3F8 94 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SPTAN1-232ENST00000636483 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA8O94911 1581 aa-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP290O15078 2479 aa-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 LAMA1P25391 3075 aa-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 MT4P47944 62 aa-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.64□□□□□ -2.51
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