RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	FABP2	P12104	132 aa		7.73	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	XP32	Q5T750	250 aa		7.73	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		7.73	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PPM0	123 aa		7.71	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	VAMP3	Q15836	100 aa		7.71	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		7.71	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.71	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	CFC1	P0CG37	223 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	C6orf99	Q4VX62	202 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		7.69	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2V1	Q13404	147 aa		7.69	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468		H3BUT2	72 aa		7.68	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468		K7ERJ3	54 aa		7.68	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		7.67	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		7.67	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.67	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.67	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468		K7EP34	96 aa		7.66	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	COX7B	P24311	80 aa		7.66	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		7.66	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR1B	P22528	89 aa		7.65	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		7.65	□□□□□ -1.18
MUC1-222	ENST00000610468	COX6C	P09669	75 aa		7.64	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		7.64	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.64	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		7.62	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468		Q1RN00	199 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		7.61	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00575	Q6W349	94 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM29	Q86T20	159 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468	PSMB2	P49721	201 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MUC1-222	ENST00000610468		F8W1H4	67 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	LIMD2	Q9BT23	127 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	MT1H	P80294	61 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	ATXN8	Q156A1	80 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	PCOTH	Q58A44	107 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468		H7C2G1	150 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	TRIAP1	O43715	76 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MUC1-222	ENST00000610468	hADV29S1	A0JD25	119 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		H0YGX0	51 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		H3BMG7	143 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	CD164	Q04900	197 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf92	A6NGG3	77 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	LST1	O00453	97 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	SNCG	O76070	127 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		Q5XG85	94 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZQY7	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GX51	115 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	TCL1B	O95988	128 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	TRAC	P01848	142 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		H3BT86	120 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		J3QR89	54 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		K7ERU9	68 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468	PRO0461	Q9UI25	63 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0G2JQZ4	141 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468		H3BQ85	93 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	DNAL4	O96015	105 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	GHRH	P01286	108 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	C1orf195	Q5TG92	126 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC2B	Q92478	149 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	TEN1	Q86WV5	123 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468		C9JAW5	83 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MUC1-222	ENST00000610468	ETDB	Q3ZM63	59 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	IGFL1	Q6UW32	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	LCE2B	O14633	110 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468		M0R2T5	61 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468	MTURN	Q8N3F0	131 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468		Q6JHZ5	121 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468		Q6Q795	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms