RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZVH6 145 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PCP2Q8IVA1 136 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SSPOA2VEC9 5147 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CFC1P0CG37 223 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6JHZ5 121 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CLEC2BQ92478 149 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFL1Q6UW32 110 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTDAPP60985 99 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00575Q6W349 94 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZQY7 126 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 VAMP3Q15836 100 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 hADV29S1A0JD25 119 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 S100A1P23297 94 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf202A1L168 122 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ATOH7Q8N100 152 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 Q96NJ1 140 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 LST1O00453 97 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MUU9 505 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BUT2 72 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SCGB1D1O95968 90 aa5.21□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.21□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.21□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 MT2AP02795 61 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1FP04733 61 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 TEN1Q86WV5 123 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WSZ3 146 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 C12orf57Q99622 126 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM236CP0DP71 79 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DSCR10P59022 87 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-10P60014 251 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H4GQ99525 98 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SNCGO76070 127 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 HRES1P13985 223 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00313P59037 77 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGMAR1Q99720 223 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BMG7 143 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PNM2 257 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 H0YGX0 51 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV4-1P06312 121 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 S100A2P29034 98 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB37Q96AX2 223 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0B4J2C4 111 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 COX8AP10176 69 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 FABP2P12104 132 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GX51 115 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 DLEU1O43261 78 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00846Q9NV44 126 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MTURNQ8N3F0 131 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 HIGD1BQ9P298 99 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GV72 72 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C14orf144Q96I85 54 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIAP1O43715 76 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 S100A6P06703 90 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.9 ms