RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N1X5	172 aa		5.55	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.55	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.55	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GX51	115 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAL4	O96015	105 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAC	P01848	142 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BT86	120 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576		J3KT08	172 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	HERC2	O95714	4834 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N377	158 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	UQCRQ	O14949	82 aa		5.49	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYCBP2	O75592	4640 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPRR1B	P22528	89 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5.46	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	GHRH	P01286	108 aa		5.46	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.46	□□□□□ -1.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	OXT	P01178	125 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087X002	238 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	COX7C	P15954	63 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BQ85	93 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRYGA	P11844	174 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACYP1	P07311	99 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.43	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.43	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00643	Q86TS7	51 aa		5.43	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q5XG85	94 aa		5.42	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576		F8WEM9	126 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOBP	Q13875	183 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8NBF4	154 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM258	P61165	79 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNXB	P22105	4242 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATOX1	O00244	68 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WVE0	104 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGFL1	Q6UW32	110 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6JHZ5	121 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00846	Q9NV44	126 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERP2	Q8N6R1	65 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCK	P06307	115 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZQT0	140 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PNM2	257 aa		5.32	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE6G	P18545	87 aa		5.31	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5.31	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBL5	Q9BZL1	73 aa		5.31	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.31	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.3	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD164	Q04900	197 aa		5.29	□□□□□ -1.56
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WSZ3	146 aa		5.27	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINK1	P00995	79 aa		5.27	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.27	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.7 ms