RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 A0A1B0GWB2 263 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 A6NDN8 102 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 TPRXLQ17RH7 258 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 COX8AP10176 69 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 A4D1N5 150 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 DLEU1O43261 78 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 Q8N377 158 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 SMIM29Q86T20 159 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.3□□□□□ -1.4
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SMAD4-211ENST00000590499 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 SLC25A20O43772 301 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 TAL2Q16559 108 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 Q1RN00 199 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 SPATA45Q537H7 98 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 HIST1H4GQ99525 98 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.28□□□□□ -1.4
SMAD4-211ENST00000590499 C14orf144Q96I85 54 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 HIGD1BQ9P298 99 aa6.27□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 LINC00575Q6W349 94 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 C12orf57Q99622 126 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 VAMP8Q9BV40 100 aa6.26□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 CD164Q04900 197 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 VAMP3Q15836 100 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 PRO1933Q9H354 126 aa6.24□□□□□ -1.41
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SMAD4-211ENST00000590499 CFC1P0CG37 223 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 hADV29S1A0JD25 119 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 IGKV2-30P06310 120 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 PYY3Q5JQD4 70 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 LIMD2Q9BT23 127 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-211ENST00000590499 A0A0B4J2C4 111 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 Q5XG85 94 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 Q6ZQY7 126 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 A0A0G2JQZ4 141 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 H7C2G1 150 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 CEND1Q8N111 149 aa6.19□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.18□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.18□□□□□ -1.42
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SMAD4-211ENST00000590499 F8WEM9 126 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 C1orf195Q5TG92 126 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-211ENST00000590499 A0A0U1RQV1 116 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 H0YGX0 51 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 Q6JHZ5 121 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 HSD52Q0P140 79 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 IGFL1Q6UW32 110 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 CLEC2BQ92478 149 aa6.13□□□□□ -1.43
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SMAD4-211ENST00000590499 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 A0A1B0GX51 115 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 TCL1BO95988 128 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 C9orf92A6NGG3 77 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 H3BUT2 72 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 K7ERJ3 54 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD4-211ENST00000590499 SNCGO76070 127 aa6.08□□□□□ -1.44
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SMAD4-211ENST00000590499 Q6Q795 121 aa6.05□□□□□ -1.44
SMAD4-211ENST00000590499 PCOTHQ58A44 107 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD4-211ENST00000590499 LCE1EQ5T753 118 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD4-211ENST00000590499 H3BMG7 143 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 PSMB2P49721 201 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 FABP2P12104 132 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 TEN1Q86WV5 123 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 COX6CP09669 75 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 A0A1W2PNM2 257 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 H3BQ85 93 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 LST1O00453 97 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 DNAL4O96015 105 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-211ENST00000590499 SMIM6P0DI80 62 aa5.98□□□□□ -1.45
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