RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588177.1

SOX9-AS1-215, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 465 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-215ENST00000588177 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.83□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.82□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 F8WEM9 126 aa5.82□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 H3BT86 120 aa5.82□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.82□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 MTURNQ8N3F0 131 aa5.82□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.82□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SPRR1BP22528 89 aa5.81□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LINC00483Q53H64 154 aa5.81□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q8N377 158 aa5.81□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.81□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 UBE2V1Q13404 147 aa5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 F8W1H4 67 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 CRYGAP11844 174 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A1B0GV72 72 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 MOBPQ13875 183 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q8NBF4 154 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 PRO0461Q9UI25 63 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 FAT1Q14517 4588 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SMIM29Q86T20 159 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A087X002 238 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 DSCR8Q96T75 97 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q6JHZ5 121 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LINC01600Q96MT4 127 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TEN1Q86WV5 123 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-215ENST00000588177 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ETDBQ3ZM63 59 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.7□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LCE3BQ5TA77 95 aa5.7□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 OXTP01178 125 aa5.69□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 PDE6GP18545 87 aa5.69□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 IGFL1Q6UW32 110 aa5.69□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.69□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 VPS25Q9BRG1 176 aa5.69□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.68□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.68□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 HERC2O95714 4834 aa5.67□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 CCKP06307 115 aa5.67□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.67□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.66□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q6ZQT0 140 aa5.66□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A0G2JQZ4 141 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 CD164Q04900 197 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q6Q795 121 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LIMD2Q9BT23 127 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A1W2PNM2 257 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 J3QR89 54 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SPINK1P00995 79 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP10-8P60410 259 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A1B0GW54 56 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A087WSZ3 146 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 MT1HL1P0DM35 61 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ACYP1P07311 99 aa5.57□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.57□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TNXBP22105 4242 aa5.56□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 MYCBP2O75592 4640 aa5.56□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.56□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.56□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.56□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 K7ERU9 68 aa5.55□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 NREPQ16612 68 aa5.55□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q5XG85 94 aa5.55□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 UBL5Q9BZL1 73 aa5.55□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.53□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LINC00846Q9NV44 126 aa5.53□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.51□□□□□ -1.53
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q6ZVQ6 151 aa5.51□□□□□ -1.53
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SIGMAR1Q99720 223 aa5.51□□□□□ -1.53
SOX9-AS1-215ENST00000588177 J3KT08 172 aa5.49□□□□□ -1.53
SOX9-AS1-215ENST00000588177 BPY2O14599 106 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms