RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A096LNI7 61 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf22Q8N5N4 141 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 COX7CP15954 63 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP10-1P60331 282 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 LRCOL1A6NCL2 159 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf163Q8N9P6 203 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00474Q9P2X8 69 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WVE0 104 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-204ENST00000587718 SERP2Q8N6R1 65 aa15.96■□□□□ 0.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa15.87■□□□□ 0.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 HERC1Q15751 4861 aa15.73■□□□□ 0.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf197Q8N268 126 aa15.49■□□□□ 0.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF861PO60384 105 aa15.34■□□□□ 0.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00472Q9H8W2 130 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0U1RQV1 116 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM236CP0DP71 79 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-204ENST00000587718 OXTP01178 125 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-204ENST00000587718 FAT3Q8TDW7 4589 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MWP4 228 aa15.24■□□□□ 0.03
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR15Q8IV56 129 aa15.23■□□□□ 0.03
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