RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582892.1

NF1-222, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-222	ENST00000582892	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NF1-222	ENST00000582892	ATOX1	O00244	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	NCR3	O14931	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892		Q8NDZ9	215 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892		M0R378	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	UQCRQ	O14949	82 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	VPREB1	P12018	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	BCE1	O60756	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	COX7B	P24311	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZQT0	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	COX7C	P15954	63 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	CRYGA	P11844	174 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZQY7	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZRU5	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZSA8	131 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NF1-222	ENST00000582892	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	RMI2	Q96E14	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892		A0A1B0GW54	56 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	CXCL6	P80162	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZRP5	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	PRY	O14603	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZVQ6	151 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NF1-222	ENST00000582892	SPRR1A	P35321	89 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892		A0A087WVE0	104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	PSCA	O43653	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	TMEM258	P61165	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892		Q6ZRX8	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892		Q8N377	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892		J3KT08	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NF1-222	ENST00000582892	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	NREP	Q16612	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	NDUFC1	O43677	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892		Q9BRP9	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892		Q8NBF4	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NF1-222	ENST00000582892	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms