RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	TRIAP1	O43715	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	GHRH	P01286	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		H3BQ85	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566		Q6ZRX8	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566		F8W1H4	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	TRAC	P01848	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	COX7B	P24311	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	LST1	O00453	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	SLC25A20	O43772	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	DNAL4	O96015	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566		H3BT86	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	TCL1B	O95988	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566		H3BMG7	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	CRYGA	P11844	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TSC2-223	ENST00000568566	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566		C9JAW5	83 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	MOBP	Q13875	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566		Q8N377	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566		J3QR89	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	SPRR1B	P22528	89 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566		Q8NBF4	154 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566		Q6ZQY7	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TSC2-223	ENST00000568566		K7ERU9	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	LCE2B	O14633	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	PDE6G	P18545	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GV72	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	ACYP1	P07311	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TSC2-223	ENST00000568566	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GW54	56 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566		F8WEM9	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	SPINK1	P00995	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566		Q6JHZ5	121 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	CCK	P06307	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TSC2-223	ENST00000568566	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PNM2	257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566		Q6ZQT0	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	CD164	Q04900	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TSC2-223	ENST00000568566		Q6Q795	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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