RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.81□□□□□ -1.64
SMAD3-211ENST00000559460 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.81□□□□□ -1.64
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SMAD3-211ENST00000559460 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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SMAD3-211ENST00000559460 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.72□□□□□ -1.65
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SMAD3-211ENST00000559460 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.71□□□□□ -1.66
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SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GWB2 263 aa4.63□□□□□ -1.67
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SMAD3-211ENST00000559460 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.6□□□□□ -1.67
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SMAD3-211ENST00000559460 SPRR2BP35325 72 aa4.56□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 SPRR2AP35326 72 aa4.56□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 DSCR10P59022 87 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.55□□□□□ -1.68
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