RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 Q1RN00 199 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZRX8 168 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SPANXCQ9NY87 97 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0G2JQZ4 141 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00587B1AMM8 73 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV6-57P01721 117 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SPRR1AP35321 89 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 C6orf99Q4VX62 202 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 TIMM17BO60830 172 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFC2O95298 119 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 COX7BP24311 80 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA45Q537H7 98 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 C14orf144Q96I85 54 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 LRP2P98164 4655 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1B0GV72 72 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 DSCR10P59022 87 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 HIST1H4GQ99525 98 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 VAMP8Q9BV40 100 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 RNF213Q63HN8 5207 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 AKR1D1P51857 326 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 TAL2Q16559 108 aa2.43□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf92A6NGG3 77 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 K7ERJ3 54 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 COX8AP10176 69 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 IFITM1P13164 125 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00483Q53H64 154 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 RAB37Q96AX2 223 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1B0GWB2 263 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 FXYD2P54710 66 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 PYY3Q5JQD4 70 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZQY7 126 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 MTURNQ8N3F0 131 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 COPS9Q8WXC6 57 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 PRO1933Q9H354 126 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD3-204ENST00000558666 F8WEM9 126 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 H3BUT2 72 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A20O43772 301 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SEC61GP60059 68 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZVH6 145 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 CLEC2BQ92478 149 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 hADV29S1A0JD25 119 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 CXCL6P80162 114 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 VAMP3Q15836 100 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00575Q6W349 94 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 CEND1Q8N111 149 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SPINK1P00995 79 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SPRR1BP22528 89 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 PSMB2P49721 201 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 TPRXLQ17RH7 258 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 LIMD2Q9BT23 127 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0B4J2C4 111 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 DLEU1O43261 78 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 FABP2P12104 132 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 HSD52Q0P140 79 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 BATFQ16520 125 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 IGFL1Q6UW32 110 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 HIGD1BQ9P298 99 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 SIGMAR1Q99720 223 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 VPS25Q9BRG1 176 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-204ENST00000558666 DNAL4O96015 105 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-204ENST00000558666 CTAG1AP78358 180 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-204ENST00000558666 PCOTHQ58A44 107 aa2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms