RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556541.1

FOXN3-212, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 388 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-212ENST00000556541 CRYGAP11844 174 aa6.7□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 Q8N377 158 aa6.7□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.7□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.69□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.69□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.68□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 SMIM29Q86T20 159 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 LCE2BO14633 110 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 KRTAP10-8P60410 259 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 UBE2V1Q13404 147 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 A0A087X002 238 aa6.65□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.65□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.65□□□□□ -1.34
FOXN3-212ENST00000556541 Q8NBF4 154 aa6.64□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 H3BT86 120 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 K7EP34 96 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 MT1HL1P0DM35 61 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 F8WEM9 126 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 Q6JHZ5 121 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 MYCBP2O75592 4640 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 C9JAW5 83 aa6.6□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 H3BMG7 143 aa6.6□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 CD164Q04900 197 aa6.6□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 MOBPQ13875 183 aa6.59□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.59□□□□□ -1.35
FOXN3-212ENST00000556541 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 TNXBP22105 4242 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 PRO0461Q9UI25 63 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 Q6Q795 121 aa6.56□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.56□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 F8W1H4 67 aa6.55□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 SPINK1P00995 79 aa6.55□□□□□ -1.36
FOXN3-212ENST00000556541 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.54□□□□□ -1.36
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FOXN3-212ENST00000556541 Q5XG85 94 aa6.54□□□□□ -1.36
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FOXN3-212ENST00000556541 A0A1B0GW54 56 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 TEN1Q86WV5 123 aa6.51□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 A0A1B0GV90 55 aa6.5□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 DSCR8Q96T75 97 aa6.5□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 LIMD2Q9BT23 127 aa6.49□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.49□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.48□□□□□ -1.37
FOXN3-212ENST00000556541 MTURNQ8N3F0 131 aa6.48□□□□□ -1.37
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FOXN3-212ENST00000556541 A0A1W2PNM2 257 aa6.46□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 CCKP06307 115 aa6.45□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.45□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.44□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 A0A0G2JQZ4 141 aa6.43□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 ETDBQ3ZM63 59 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 RNF213Q63HN8 5207 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 A0A1B0GV72 72 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 LCE2CQ5TA81 110 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-212ENST00000556541 A0A087WSZ3 146 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 C1orf195Q5TG92 126 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 VPS25Q9BRG1 176 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 Q96NJ1 140 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-212ENST00000556541 ACYP1P07311 99 aa6.33□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 J3KT08 172 aa6.32□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 TPRXLQ17RH7 258 aa6.3□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.29□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 NREPQ16612 68 aa6.29□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.29□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 J3QR89 54 aa6.28□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 UBL5Q9BZL1 73 aa6.28□□□□□ -1.4
FOXN3-212ENST00000556541 PRR4Q16378 134 aa6.27□□□□□ -1.41
FOXN3-212ENST00000556541 Q6ZVQ6 151 aa6.27□□□□□ -1.41
FOXN3-212ENST00000556541 LINC00846Q9NV44 126 aa6.27□□□□□ -1.41
FOXN3-212ENST00000556541 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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