RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.29	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984		Q8N1X5	172 aa		4.29	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087WZ39	114 aa		4.28	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.28	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984	CXCL6	P80162	114 aa		4.28	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984	NREP	Q16612	68 aa		4.28	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.28	□□□□□ -1.72
FGD4-215	ENST00000551984	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.27	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087WTM6	91 aa		4.27	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.27	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.26	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	CD164	Q04900	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.26	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	PRY	O14603	147 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	BPY2	O14599	106 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	LELP1	Q5T871	98 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984		Q6ZRP5	223 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984		Q1T7F1	81 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2L6	O14933	153 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.22	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.22	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.22	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	HERC1	Q15751	4861 aa		4.21	□□□□□ -1.73
FGD4-215	ENST00000551984	PSCA	O43653	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	PDE6G	P18545	87 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		Q8N9L7	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	PSPHP1	O15172	72 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		Q5VSD8	79 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		Q8NDZ9	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		A8MU10	97 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		Q6ZQY7	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		Q6ZSA8	131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		Q8IZM0	81 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984		A8MUN3	132 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984		H3BQ85	93 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	COX17	Q14061	63 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	COX7B	P24311	80 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984		Q5VV11	94 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2B	P63146	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984		M0R378	163 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	PRR4	Q16378	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GUV1	79 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2A	P49459	152 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FGD4-215	ENST00000551984	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75

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