RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 Q75L30 129 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 C20orf202A1L168 122 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 F8WEM9 126 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 Q96NJ1 140 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 MT2AP02795 61 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 IGFL1Q6UW32 110 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 LINC01545Q5VT33 79 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 A4D1N5 150 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 MT1FP04733 61 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-227ENST00000551441 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 CLEC2BQ92478 149 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 Q6ZQY7 126 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 PET117Q6UWS5 81 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 COLCA2A8K830 154 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 LST1O00453 97 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 IFITM1P13164 125 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 Q6JHZ5 121 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 LINC00575Q6W349 94 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 C3orf79P0CE67 100 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 FAM236CP0DP71 79 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 KRTAP10-10P60014 251 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 COPS9Q8WXC6 57 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-227ENST00000551441 H3BUT2 72 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 hADV29S1A0JD25 119 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 A8MUU9 505 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 ATOH7Q8N100 152 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 KRTDAPP60985 99 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 VAMP3Q15836 100 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BKO60814 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BJP06899 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BOP23527 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BBP33778 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BDP58876 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 DSCR10P59022 87 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BCP62807 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 Q6ZVH6 145 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-227ENST00000551441 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-227ENST00000551441 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-227ENST00000551441 C12orf57Q99622 126 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 HRES1P13985 223 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 A0A087WSZ3 146 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 SIGMAR1Q99720 223 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 TEN1Q86WV5 123 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-227ENST00000551441 SCGB1D1O95968 90 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 LINC00313P59037 77 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 LINC00846Q9NV44 126 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-227ENST00000551441 IGKV4-1P06312 121 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PNM2 257 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 H3BMG7 143 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GV72 72 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 FABP2P12104 132 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 HIST1H4GQ99525 98 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-227ENST00000551441 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 MTURNQ8N3F0 131 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 SNCGO76070 127 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 RAB37Q96AX2 223 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-227ENST00000551441 H0YGX0 51 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 SPINK7P58062 85 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 A8MWP4 228 aa7.68□□□□□ -1.18
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