RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 V9GYY9 64 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 TNP2Q05952 138 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 PRLHP81277 87 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
PRAME-214ENST00000543184 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 H3BNG1 76 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 KMT2AQ03164 3969 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 PSPHP1O15172 72 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 PSCAO43653 123 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 hDV103S1A0JD37 113 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 SPRR1AP35321 89 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 A0A087WSZ3 146 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 IGFL1Q6UW32 110 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 SPRR4Q96PI1 79 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.96□□□□□ -0.97
PRAME-214ENST00000543184 A0A096LNI7 61 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 HCG22E2RYF7 251 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 REG3GQ6UW15 175 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 LCE6AA0A183 80 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 A8MU10 97 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 LINC00208Q96KT6 92 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 CHTF8P0CG12 524 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-214ENST00000543184 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.9□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 A8MUN3 132 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 APLNQ9ULZ1 77 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 UBE2AP49459 152 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 NUPR2A6NF83 97 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 LY6G6CO95867 125 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 A0A1B0GW54 56 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-214ENST00000543184 PMAIP1Q13794 54 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 Q1T7F1 81 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 MP68P56378 58 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 H0Y9P7 68 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 CASC2Q6XLA1 102 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 PRR15Q8IV56 129 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 DNAH2Q9P225 4427 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 H0Y9J4 135 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-214ENST00000543184 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 C16orf90A8MZG2 172 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 PCOTHQ58A44 107 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 PANO1I0J062 215 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 Q5VV11 94 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 NDUFB1O75438 58 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-214ENST00000543184 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 A8MWP4 228 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 PRR15LQ9BU68 103 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 RYR3Q15413 4870 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-214ENST00000543184 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 COA5Q86WW8 74 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 NDUFS5O43920 106 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 RYR2Q92736 4967 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 CD164Q04900 197 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 PKHD1P08F94 4074 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 A0A087X002 238 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 SPRR1BP22528 89 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-214ENST00000543184 Q96NJ1 140 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 MOBPQ13875 183 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 LCA10Q71F78 164 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-214ENST00000543184 A6NED7 52 aa8.56□□□□□ -1.04
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