RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542447.6

CADM1-212, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM1, Length 4,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-212ENST00000542447 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.52□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 PRR34Q9NV39 138 aa7.52□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.51□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 COA5Q86WW8 74 aa7.5□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 IGFL1Q6UW32 110 aa7.49□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.49□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 CASC10Q5T4H9 136 aa7.48□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 Q5VV11 94 aa7.47□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 VWFP04275 2813 aa7.47□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 C16orf90A8MZG2 172 aa7.47□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 CHTF8P0CG12 524 aa7.45□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.44□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP10-3P60369 221 aa7.44□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.44□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.43□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.43□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.42□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.41□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.4□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.4□□□□□ -1.22
CADM1-212ENST00000542447 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.39□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.38□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 A0A1B0GW54 56 aa7.37□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 PRAC1Q96KF2 57 aa7.37□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 SPINK1P00995 79 aa7.37□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.36□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 A8MWP4 228 aa7.35□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 LCA10Q71F78 164 aa7.35□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.34□□□□□ -1.23
CADM1-212ENST00000542447 MDFIQ99750 246 aa7.34□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 TENM3Q9P273 2699 aa7.33□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 SPRR4Q96PI1 79 aa7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.32□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.31□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 MOBPQ13875 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 SPINK7P58062 85 aa7.3□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 LCE6AA0A183 80 aa7.29□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 Q75L30 129 aa7.29□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.29□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 A0A1B0GU69 56 aa7.28□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 H3BPC8 53 aa7.28□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 AKAP9Q99996 3911 aa7.28□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CADM1-212ENST00000542447 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.24□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 IGKV2-30P06310 120 aa7.24□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.24□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.23□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 A6NN06 94 aa7.23□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.23□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 TNP2Q05952 138 aa7.22□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.22□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.22□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP10-11P60412 298 aa7.22□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 C14orf177Q52M58 125 aa7.22□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 H3BNG1 76 aa7.21□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 H3BS24 57 aa7.21□□□□□ -1.25
CADM1-212ENST00000542447 C8orf87E5RJ46 101 aa7.21□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 ACYP2P14621 99 aa7.2□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 LINC00313P59037 77 aa7.19□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.19□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 K7EIL1 84 aa7.18□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 SPRR1AP35321 89 aa7.18□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 HRES1P13985 223 aa7.17□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.17□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.16□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.16□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.16□□□□□ -1.26
CADM1-212ENST00000542447 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.14□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 TENM2Q9NT68 2774 aa7.14□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 A0A1B0GVX0 72 aa7.14□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.13□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.13□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.12□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 LINC01554Q52M75 96 aa7.12□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.11□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 RTL8CO15255 209 aa7.11□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 UQCR11O14957 56 aa7.08□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.07□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.07□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 A0A087X002 238 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 COL7A1Q02388 2944 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.6 ms