RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 A6NED7 52 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 A8MWP4 228 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 C16orf90A8MZG2 172 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 A0A087WSZ3 146 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 COA5Q86WW8 74 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 F8P00451 2351 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-215ENST00000537304 FAM168BA1KXE4 195 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 RETNQ9HD89 108 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 A6NN06 94 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 SPRR1BP22528 89 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 H0Y9J4 135 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 LCA10Q71F78 164 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 MOBPQ13875 183 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 ATRQ13535 2644 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.77□□□□□ -1.32
LMO3-215ENST00000537304 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 A8MU10 97 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZR54 194 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 VWFP04275 2813 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 PRLHP81277 87 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 A0A0G2JQZ4 141 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PNN7 141 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-215ENST00000537304 C14orf177Q52M58 125 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 PCOTHQ58A44 107 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 A0A087X002 238 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 A0A096LNI7 61 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 CDK2AP2O75956 126 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 CASC10Q5T4H9 136 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP10-11P60412 298 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 HRES1P13985 223 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-215ENST00000537304 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GVX0 72 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 STAB1Q9NY15 2570 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 SPINK7P58062 85 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 ACYP2P14621 99 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 Q96NJ1 140 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 MAST4O15021 2626 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-215ENST00000537304 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 COL6A5A8TX70 2615 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 LINC00483Q53H64 154 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 MDFIQ99750 246 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 C8orf87E5RJ46 101 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 LINC00313P59037 77 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-215ENST00000537304 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 K7EIL1 84 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 ANK2Q01484 3957 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GU69 56 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 DMAC1Q96GE9 116 aa6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-215ENST00000537304 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 LINC01554Q52M75 96 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 NOTCH1P46531 2555 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 UQCR11O14957 56 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-215ENST00000537304 TENM3Q9P273 2699 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-215ENST00000537304 FAM229AH3BQW9 127 aa6.45□□□□□ -1.38
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