RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NCR3O14931 201 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ERC2-IT1O76042 136 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A12P80511 92 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VAMP3Q15836 100 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 F8W036 122 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PPBPP02775 128 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A2P29034 98 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR1AP35321 89 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COX17Q14061 63 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF345Q14585 488 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRELID3AQ96N28 172 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1B0GW15 77 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGIPA6NJ69 53 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 H7C2G1 150 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM236CP0DP71 79 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OSTCQ9NRP0 149 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM250H0YL14 139 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMLR1H3BR10 107 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 H3BRM9 83 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A8P05109 93 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00158P58513 81 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q9BRP9 147 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 V9GYV3 84 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.77□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HMSDA8MTL9 139 aa2.77□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C1orf195Q5TG92 126 aa2.77□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q6ZRX8 168 aa2.77□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.77□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BATF3Q9NR55 127 aa2.77□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q8N8P6 123 aa2.76□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.75□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.75□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TOMM6Q96B49 74 aa2.75□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.75□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.75□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 K7EMI3 77 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 G0S2P27469 103 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CD164Q04900 197 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SFTA2Q6UW10 78 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DDTP30046 118 aa2.73□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADIRFQ15847 76 aa2.73□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q5XG85 94 aa2.73□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ALKAL2Q6UX46 152 aa2.73□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CST9LQ9H4G1 147 aa2.73□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADCYAP1P18509 176 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP12-1P59990 96 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRO1933Q9H354 126 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TCL1BO95988 128 aa2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMIM13P0DJ93 91 aa2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A6NN06 94 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGLC3P0DOY3 106 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR1BP22528 89 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFA6P56556 154 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A0G2JQZ4 141 aa2.69□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC01549A6NIU2 74 aa2.69□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AKR1D1P51857 326 aa2.69□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.69□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q96NJ1 140 aa2.69□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC51BQ86UW2 128 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAT8Q9UHE5 227 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COMMD7Q86VX2 200 aa2.66□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.66□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C11orf86A6NJI1 115 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00587B1AMM8 73 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR2EP22531 72 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR2BP35325 72 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms