RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.81□□□□□ -1.96
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 NCR3O14931 201 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ERC2-IT1O76042 136 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A12P80511 92 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VAMP3Q15836 100 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.81□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 F8W036 122 aa2.8□□□□□ -1.96
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF345Q14585 488 aa2.8□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.79□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OSTCQ9NRP0 149 aa2.79□□□□□ -1.96
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A8P05109 93 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.78□□□□□ -1.96
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.78□□□□□ -1.96
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 HMSDA8MTL9 139 aa2.77□□□□□ -1.97
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q6ZRX8 168 aa2.77□□□□□ -1.97
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.75□□□□□ -1.97
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 CST9LQ9H4G1 147 aa2.73□□□□□ -1.97
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP12-1P59990 96 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRO1933Q9H354 126 aa2.72□□□□□ -1.97
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMIM13P0DJ93 91 aa2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A6NN06 94 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGLC3P0DOY3 106 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR1BP22528 89 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFA6P56556 154 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.7□□□□□ -1.98
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.68□□□□□ -1.98
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC51BQ86UW2 128 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAT8Q9UHE5 227 aa2.67□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COMMD7Q86VX2 200 aa2.66□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.66□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C11orf86A6NJI1 115 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00587B1AMM8 73 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR2EP22531 72 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRR2BP35325 72 aa2.65□□□□□ -1.99
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