RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.72□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.71□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.71□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 C1orf137Q5JT78 98 aa4.71□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.71□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 SMIM29Q86T20 159 aa4.71□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 LCE4AQ5TA78 99 aa4.7□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 ERC2-IT1O76042 136 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 COX7CP15954 63 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 NREPQ16612 68 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 SERP2Q8N6R1 65 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.69□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PNM2 257 aa4.68□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 RTL8CO15255 209 aa4.68□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.68□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.68□□□□□ -1.66
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PACS1-211ENST00000531298 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 M0R2N4 97 aa4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 UBE2AP49459 152 aa4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 HAMPP81172 84 aa4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 LINC00483Q53H64 154 aa4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.67□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 CHTF8P0CG12 524 aa4.66□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.66□□□□□ -1.66
PACS1-211ENST00000531298 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.65□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.65□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 BPY2O14599 106 aa4.65□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 PRLHP81277 87 aa4.65□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.65□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 IGFL1Q6UW32 110 aa4.64□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.63□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 ZNF861PO60384 105 aa4.63□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.63□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WVE0 104 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 CCDC179H3BU77 68 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 PANO1I0J062 215 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 J3KT08 172 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 LY6G6CO95867 125 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZSA8 131 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 DPH3Q96FX2 82 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.62□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 IGKV4-1P06312 121 aa4.61□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.61□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 NDUFC1O43677 76 aa4.6□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 KLKP1Q107X0 134 aa4.6□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.6□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.6□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.59□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 CD164Q04900 197 aa4.59□□□□□ -1.67
PACS1-211ENST00000531298 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.59□□□□□ -1.67
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PACS1-211ENST00000531298 TENM2Q9NT68 2774 aa4.59□□□□□ -1.68
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PACS1-211ENST00000531298 IGLV7-43P04211 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 DSCR10P59022 87 aa4.58□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 TMEM258P61165 79 aa4.58□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.57□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 LCE6AA0A183 80 aa4.57□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.57□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.57□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.56□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WSZ3 146 aa4.56□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.56□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.56□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 OCR1Q9BZK8 76 aa4.56□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 A8MWP4 228 aa4.55□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.55□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 KMT2AQ03164 3969 aa4.54□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 HCG22E2RYF7 251 aa4.54□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 Q5XG85 94 aa4.54□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 PRR15Q8IV56 129 aa4.54□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.54□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 DNAH2Q9P225 4427 aa4.54□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 H3BPC8 53 aa4.53□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 C5orf47Q569G3 176 aa4.53□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 SCXQ7RTU7 201 aa4.53□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.53□□□□□ -1.68
PACS1-211ENST00000531298 NDUFB1O75438 58 aa4.52□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP10-2P60368 255 aa4.52□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 K7EQZ3 153 aa4.51□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.5□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 MOBPQ13875 183 aa4.5□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 C20orf197Q8N268 126 aa4.5□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.5□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 A0A0U1RQV1 116 aa4.49□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP10-1P60331 282 aa4.49□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 Q8N9L7 120 aa4.49□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 Q96NJ1 140 aa4.49□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.49□□□□□ -1.69
PACS1-211ENST00000531298 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.49□□□□□ -1.69
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