RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM29Q86T20 159 aa5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRO0461Q9UI25 63 aa5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYGAP11844 174 aa5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RYR1P21817 5038 aa5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087X002 238 aa5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOBPQ13875 183 aa5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01600Q96MT4 127 aa5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ETDBQ3ZM63 59 aa5.04□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.04□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSCR8Q96T75 97 aa5.04□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.04□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.04□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSPG2P98160 4391 aa5.03□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.03□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.03□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEN1Q86WV5 123 aa5.03□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8NBF4 154 aa5.03□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.03□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0G2JQZ4 141 aa5.02□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6JHZ5 121 aa5.02□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.02□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAT1Q14517 4588 aa5.01□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.01□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.01□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS25Q9BRG1 176 aa5.01□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C4orf48Q5BLP8 95 aa5□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGFL1Q6UW32 110 aa5□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HRCT1Q6UXD1 115 aa5□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.99□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.99□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDE6GP18545 87 aa4.99□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.99□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OXTP01178 125 aa4.98□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCKP06307 115 aa4.98□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZQT0 140 aa4.98□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP10-8P60410 259 aa4.97□□□□□ -1.61
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PNM2 257 aa4.96□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.96□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD164Q04900 197 aa4.95□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.95□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.94□□□□□ -1.62
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 J3QL48 77 aa4.94□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.94□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6Q795 121 aa4.94□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HERC2O95714 4834 aa4.93□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087WSZ3 146 aa4.93□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 J3QR89 54 aa4.93□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPINK1P00995 79 aa4.93□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1HL1P0DM35 61 aa4.92□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GW54 56 aa4.91□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.91□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACYP1P07311 99 aa4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIMD2Q9BT23 127 aa4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 K7ERU9 68 aa4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NREPQ16612 68 aa4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBL5Q9BZL1 73 aa4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00846Q9NV44 126 aa4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q5XG85 94 aa4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZVQ6 151 aa4.85□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf195Q5TG92 126 aa4.84□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.84□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV4-1P06312 121 aa4.83□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.83□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.83□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BPY2O14599 106 aa4.82□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIGMAR1Q99720 223 aa4.82□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.81□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 J3KT08 172 aa4.81□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q96NJ1 140 aa4.81□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.8□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00643Q86TS7 51 aa4.8□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.8□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.8□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDIP1Q9H305 208 aa4.8□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFB1O75438 58 aa4.79□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR4Q16378 134 aa4.79□□□□□ -1.64
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYCBP2O75592 4640 aa4.77□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.77□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A8MWP4 228 aa4.77□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSCR10P59022 87 aa4.77□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCL6P80162 114 aa4.77□□□□□ -1.65
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
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