RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528768.5

USF1-208, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene USF1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-208ENST00000528768 CXCL6P80162 114 aa7.46□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 HAMPP81172 84 aa7.46□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 Q6ZVQ6 151 aa7.46□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.46□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.45□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 F8WEM9 126 aa7.45□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 Q8N377 158 aa7.45□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 UQCRQO14949 82 aa7.44□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 KRTAP10-2P60368 255 aa7.44□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 BCE1O60756 84 aa7.43□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.43□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.43□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 Q9BRP9 147 aa7.43□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.42□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 NREPQ16612 68 aa7.42□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.42□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.42□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 A0A1W2PNN7 141 aa7.41□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 FAM229AH3BQW9 127 aa7.41□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 CCDC179H3BU77 68 aa7.41□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 COX7CP15954 63 aa7.41□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.41□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 H0Y9J4 135 aa7.4□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.4□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 DPH3Q96FX2 82 aa7.4□□□□□ -1.22
USF1-208ENST00000528768 C1orf137Q5JT78 98 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 SERP2Q8N6R1 65 aa7.39□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 A0A087WVE0 104 aa7.38□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 UBE2AP49459 152 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 Q8NBF4 154 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 FAT1Q14517 4588 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 A0A087WTM6 91 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 BPY2O14599 106 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 ERC2-IT1O76042 136 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 CHTF8P0CG12 524 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 PRLHP81277 87 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-208ENST00000528768 CRYGAP11844 174 aa7.33□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 SPRR4Q96PI1 79 aa7.32□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 A0A1W2PNM2 257 aa7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 SPRR1BP22528 89 aa7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 SMIM29Q86T20 159 aa7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.31□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.3□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 SCXQ7RTU7 201 aa7.29□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 KRTAP10-1P60331 282 aa7.28□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USF1-208ENST00000528768 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.27□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.27□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 IGFL1Q6UW32 110 aa7.26□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 OXTP01178 125 aa7.24□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 IGKV4-1P06312 121 aa7.24□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 TMEM258P61165 79 aa7.23□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.22□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.22□□□□□ -1.25
USF1-208ENST00000528768 PANO1I0J062 215 aa7.21□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 A0A087WSZ3 146 aa7.19□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 NDUFC1O43677 76 aa7.19□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 C20orf197Q8N268 126 aa7.19□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 Q8N9L7 120 aa7.18□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 J3KT08 172 aa7.17□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 ZNF861PO60384 105 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 LINC00483Q53H64 154 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 DSCR10P59022 87 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 KLKP1Q107X0 134 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-208ENST00000528768 HCG22E2RYF7 251 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 K7EQZ3 153 aa7.12□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 NDUFB1O75438 58 aa7.12□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 A0A0G2JQZ4 141 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 OCR1Q9BZK8 76 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 IGLV7-43P04211 117 aa7.1□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 Q6ZSA8 131 aa7.1□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.1□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.1□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.09□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 A8MWP4 228 aa7.09□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 FAM236CP0DP71 79 aa7.09□□□□□ -1.27
USF1-208ENST00000528768 C5orf47Q569G3 176 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-208ENST00000528768 PRR15Q8IV56 129 aa7.07□□□□□ -1.28
USF1-208ENST00000528768 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.07□□□□□ -1.28
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