RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513346.5

TCOF1-211, Transcript of treacle ribosome biogenesis factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TCOF1, Length 4,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1-211ENST00000513346 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 A0A1W2PNM2 257 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 LCA10Q71F78 164 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 LAMA5O15230 3695 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 KRTAP10-11P60412 298 aa7.39□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.38□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.38□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.38□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.37□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 IGFL1Q6UW32 110 aa7.37□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 MOBPQ13875 183 aa7.37□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 RELNP78509 3460 aa7.36□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.36□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.36□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 RTL8CO15255 209 aa7.36□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.35□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 C16orf90A8MZG2 172 aa7.35□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 SPINK1P00995 79 aa7.34□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 FAM168BA1KXE4 195 aa7.34□□□□□ -1.23
TCOF1-211ENST00000513346 CHTF8P0CG12 524 aa7.33□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 C15orf56Q8N910 161 aa7.32□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 FAM229AH3BQW9 127 aa7.32□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.32□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 NF1P21359 2839 aa7.3□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 DSCR10P59022 87 aa7.29□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.29□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 A0A0G2JQZ4 141 aa7.29□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 A0A1W2PNN7 141 aa7.29□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.29□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 UQCR11O14957 56 aa7.28□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 CR1P17927 2039 aa7.28□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.28□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 IGKV2-30P06310 120 aa7.28□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
TCOF1-211ENST00000513346 Q8NDZ9 215 aa7.26□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 SPRR4Q96PI1 79 aa7.26□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.26□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.26□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 Q75L30 129 aa7.26□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.25□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.23□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 Q5VV11 94 aa7.23□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.22□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.22□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.2□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 A0A1B0GVX0 72 aa7.2□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00313P59037 77 aa7.19□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.17□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 A0A087WTM6 91 aa7.17□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 FBN2P35556 2912 aa7.17□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.16□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.16□□□□□ -1.26
TCOF1-211ENST00000513346 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.14□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 APLNQ9ULZ1 77 aa7.14□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 CASC10Q5T4H9 136 aa7.12□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 J3QL48 77 aa7.11□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 LINC01554Q52M75 96 aa7.11□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 ZNF861PO60384 105 aa7.1□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TCOF1-211ENST00000513346 SPRR1AP35321 89 aa7.07□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.06□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 PRAC1Q96KF2 57 aa7.06□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 Q96NJ1 140 aa7.06□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.06□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.06□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 H3BS24 57 aa7.05□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 ZFHX3Q15911 3703 aa7.05□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.05□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 SPINK7P58062 85 aa7.04□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.04□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.04□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 HRES1P13985 223 aa7.03□□□□□ -1.28
TCOF1-211ENST00000513346 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.02□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.02□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.02□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV7-43P04211 117 aa7.01□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 TNP2Q05952 138 aa7.01□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.99□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.99□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 LCE6AA0A183 80 aa6.97□□□□□ -1.29
TCOF1-211ENST00000513346 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.94□□□□□ -1.3
TCOF1-211ENST00000513346 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TCOF1-211ENST00000513346 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.93□□□□□ -1.3
TCOF1-211ENST00000513346 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TCOF1-211ENST00000513346 SPRR1BP22528 89 aa6.93□□□□□ -1.3
TCOF1-211ENST00000513346 A6NN06 94 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.7 ms