RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 DSCR10P59022 87 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 HIVEP1P15822 2718 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP10-3P60369 221 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 J3QKU1 62 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-217ENST00000510204 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 INAFM1C9JVW0 142 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 F8P00451 2351 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 NOTCH1P46531 2555 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 LELP1Q5T871 98 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 STAB1Q9NY15 2570 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 MAST4O15021 2626 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 PRR34Q9NV39 138 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 H0Y9P7 68 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 Q8N377 158 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 X6R8D5 127 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 ROMO1P60602 79 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 C1orf137Q5JT78 98 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 Q8NBF4 154 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087X002 238 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 H3BPC8 53 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR4Q96PI1 79 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-217ENST00000510204 TNP2Q05952 138 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 Q6ZRX8 168 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 C7orf33Q8WU49 177 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 TENM3Q9P273 2699 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 PCOTHQ58A44 107 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 COL6A5A8TX70 2615 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 C15orf56Q8N910 161 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 HRES1P13985 223 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 REG3GQ6UW15 175 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-217ENST00000510204 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.4□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 P0C880 135 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRR1AP35321 89 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087WSZ3 146 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-217ENST00000510204 IGFL1Q6UW32 110 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-217ENST00000510204 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF861PO60384 105 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP10-11P60412 298 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM168BA1KXE4 195 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 H3BNG1 76 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A0G2JQZ4 141 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1W2PNN7 141 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 A8MWP4 228 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1B0GU69 56 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-217ENST00000510204 UQCR11O14957 56 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00483Q53H64 154 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 A8MUU9 505 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 CASC10Q5T4H9 136 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 PRLHP81277 87 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 TENM2Q9NT68 2774 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP2-217ENST00000510204 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.15□□□□□ -1.27
SH3BP2-217ENST00000510204 NDUFAF8A1L188 74 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP2-217ENST00000510204 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP2-217ENST00000510204 ANK2Q01484 3957 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-217ENST00000510204 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.3 ms