RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 LIMD2Q9BT23 127 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0G2JQZ4 141 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 CD164Q04900 197 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00575Q6W349 94 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 FXYD2P54710 66 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 LCE2CQ5TA81 110 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 PRO1933Q9H354 126 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0B4J2C4 111 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 hADV29S1A0JD25 119 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 C9orf92A6NGG3 77 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 Q5XG85 94 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 HSD52Q0P140 79 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6ZQY7 126 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 A6NJY4 79 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 PCOTHQ58A44 107 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 C1orf195Q5TG92 126 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 K7ERJ3 54 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 H0YGX0 51 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 F8WEM9 126 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 TRIAP1O43715 76 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 MT1HP80294 61 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 SMIM6P0DI80 62 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 PSMB2P49721 201 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 CLEC2BQ92478 149 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 SNCGO76070 127 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 H3BUT2 72 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 IGFL1Q6UW32 110 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 TCL1BO95988 128 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6JHZ5 121 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1B0GX51 115 aa6.74□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 FABP2P12104 132 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 COX6CP09669 75 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 M0R143 59 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 DNAL4O96015 105 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1B0GV72 72 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 H3BMG7 143 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 TSTD3H0UI37 97 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 GHRHP01286 108 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 LST1O00453 97 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 BATFQ16520 125 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 TRACP01848 142 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6Q795 121 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-216ENST00000510193 Q75L30 129 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 TEN1Q86WV5 123 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A087WSZ3 146 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1W2PNM2 257 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 H3BQ85 93 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 Q96NJ1 140 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 UBE2V1Q13404 147 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2-216ENST00000510193 ATXN8Q156A1 80 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 A8MUU9 505 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 M0R2T5 61 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 CCKP06307 115 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 TAX1BP3O14907 124 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 VPS25Q9BRG1 176 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 C9orf118A6NHY6 69 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 DSCR10P59022 87 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 DSCR8Q96T75 97 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 C9JAW5 83 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 SIGMAR1Q99720 223 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms