RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 CCL3L1P16619 93 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPAG11BQ08648 103 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZQY7 126 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPTSSBQ8NFR3 76 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CCL17Q92583 94 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 B9D2Q9BPU9 175 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 RETNLBQ9BQ08 111 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 WFDC10AQ9H1F0 79 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 PIEZO1Q92508 2521 aa0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPEGQ15772 3267 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 PTPN13Q12923 2485 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CLPSL1A2RUU4 121 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TFF1P04155 84 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 MSMBP08118 114 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 APELAP0DMC3 54 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CCL18P55774 89 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00158P58513 81 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00313P59037 77 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00575Q6W349 94 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SCXQ7RTU7 201 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 USMG5Q96IX5 58 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CENPEQ02224 2701 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.95□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 C2CD3Q4AC94 2353 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 BSNQ9UPA5 3926 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 MUC6Q6W4X9 2439 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TRAV10A0A0B4J240 114 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 A8MWP4 228 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 COA5Q86WW8 74 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 FAM215AQ9Y5M1 114 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.94□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 EYSQ5T1H1 3165 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 A0A096LNT2 108 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 A0A1B0GU33 70 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 A0A1W2PNM2 257 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPINK13Q1W4C9 94 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 DEFB112Q30KQ8 113 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 C5orf56Q8N8D9 126 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 FDCSPQ8NFU4 85 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPRR4Q96PI1 79 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 U3KQA8 63 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF292O60281 2723 aa0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 FN1P02751 2386 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 J3QKU1 62 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 K7EQZ3 153 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 UQCR11O14957 56 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPAG11AQ6PDA7 123 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZTI0 123 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 Q8NAQ8 132 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 Q8NDZ9 215 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 DEFB108BQ8NET1 73 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TTC28Q96AY4 2481 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 NF1P21359 2839 aa0.92□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 HIVEP1P15822 2718 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 VPS13CQ709C8 3753 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 H3BUX3 64 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 IGLV1-51P01701 117 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 DEFB131AP59861 70 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 CNBPP62633 177 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 COX6A2Q02221 97 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 C1orf137Q5JT78 98 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZRX8 168 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 DMAC1Q96GE9 116 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 MTORP42345 2549 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.91□□□□□ -2.26
PDE4D-211ENST00000504624 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.91□□□□□ -2.26
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