RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 RTL8CO15255 209 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM29Q86T20 159 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WVE0 104 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GW54 56 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf137Q5JT78 98 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 DPH3Q96FX2 82 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 RYR3Q15413 4870 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL6P80162 114 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 HAMPP81172 84 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 RYR2Q92736 4967 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PNM2 257 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 BCE1O60756 84 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2AP49459 152 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 F8WEM9 126 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 ATOX1O00244 68 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR1BP22528 89 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 Q8NBF4 154 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR4Q96PI1 79 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC179H3BU77 68 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 NREPQ16612 68 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 PKD1P98161 4303 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 IGFL1Q6UW32 110 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 CRYGAP11844 174 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 SCXQ7RTU7 201 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-208ENST00000502484 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 UQCRQO14949 82 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 COX7CP15954 63 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 SEC61GP60059 68 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 BPY2O14599 106 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 PKHD1P08F94 4074 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JQZ4 141 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-2P60368 255 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 SERP2Q8N6R1 65 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GVY2 172 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV4-1P06312 121 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00483Q53H64 154 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF861PO60384 105 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 Q8N9L7 120 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WSZ3 146 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZSA8 131 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 DSCR10P59022 87 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV7-43P04211 117 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-1P60331 282 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 K7EQZ3 153 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-208ENST00000502484 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 MOBPQ13875 183 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 OCR1Q9BZK8 76 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf197Q8N268 126 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 HCG22E2RYF7 251 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 A8MWP4 228 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 J3KT08 172 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 KLKP1Q107X0 134 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 Q96NJ1 140 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 PRR15Q8IV56 129 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 CDK2AP2O75956 126 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM258P61165 79 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 V9GYY9 64 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 CD164Q04900 197 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 SNURFQ9Y675 71 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 H7BZZ5 65 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFB1O75438 58 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 XP32Q5T750 250 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99 ms