RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 MTURNQ8N3F0 131 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-210ENST00000496892 Q6ZQY7 126 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-210ENST00000496892 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-210ENST00000496892 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 Q9BRP9 147 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 TEN1Q86WV5 123 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 PRLHP81277 87 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 ETDBQ3ZM63 59 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 C1orf137Q5JT78 98 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF861PO60384 105 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 J3QR89 54 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 IGLV7-43P04211 117 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 ERC2-IT1O76042 136 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 Q8N377 158 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 K7ERU9 68 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-210ENST00000496892 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 PDE6GP18545 87 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 SPRR1BP22528 89 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 F8WEM9 126 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 DSCR8Q96T75 97 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 SPRR4Q96PI1 79 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-210ENST00000496892 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 LPAP08519 4548 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 LINC00483Q53H64 154 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 SMIM29Q86T20 159 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 A0A1B0GV72 72 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 ACYP1P07311 99 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP10-8P60410 259 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 CCKP06307 115 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 Q6JHZ5 121 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 Q6ZQT0 140 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-210ENST00000496892 A0A1B0GW54 56 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 VPS25Q9BRG1 176 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 IGFL1Q6UW32 110 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 Q8NBF4 154 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR1A-210ENST00000496892 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 MUC2Q02817 5179 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 CRYGAP11844 174 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 MOBPQ13875 183 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 Q6Q795 121 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 UBL5Q9BZL1 73 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 A0A1W2PNM2 257 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 LINC00846Q9NV44 126 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1A-210ENST00000496892 CDIP1Q9H305 208 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 CD164Q04900 197 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 LINC00643Q86TS7 51 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 NREPQ16612 68 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 A0A087X002 238 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 A0A0G2JQZ4 141 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-210ENST00000496892 A0A087WSZ3 146 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 Q6ZVQ6 151 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 SIGMAR1Q99720 223 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 A0A0U1RQV1 116 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 CXCL6P80162 114 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-210ENST00000496892 BPY2O14599 106 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-210ENST00000496892 SPINK1P00995 79 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-210ENST00000496892 PRR4Q16378 134 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-210ENST00000496892 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-210ENST00000496892 LIMD2Q9BT23 127 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-210ENST00000496892 IMUPQ9GZP8 106 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.9 ms