RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 Q8NBF4 154 aa5.47□□□□□ -1.53
VWA3B-220ENST00000495571 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.47□□□□□ -1.53
VWA3B-220ENST00000495571 TENM2Q9NT68 2774 aa5.46□□□□□ -1.53
VWA3B-220ENST00000495571 H0Y9P7 68 aa5.46□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV1-51P01701 117 aa5.46□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.46□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 PRO0255Q9UI72 69 aa5.46□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 NOTCH1P46531 2555 aa5.45□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 FAM168BA1KXE4 195 aa5.45□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFB1O75438 58 aa5.45□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 MP68P56378 58 aa5.45□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 PCOTHQ58A44 107 aa5.45□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.45□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.44□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 Q8NAQ8 132 aa5.44□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 HTN3P15516 51 aa5.43□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 SPRR4Q96PI1 79 aa5.43□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 COL7A1Q02388 2944 aa5.43□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.43□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 X6R8D5 127 aa5.43□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 STAB1Q9NY15 2570 aa5.43□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.41□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.41□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.41□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.41□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.4□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 PRR34Q9NV39 138 aa5.4□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.4□□□□□ -1.54
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087WSZ3 146 aa5.4□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.4□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 C15orf56Q8N910 161 aa5.4□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 COL6A5A8TX70 2615 aa5.39□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 FBN3Q75N90 2809 aa5.39□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP10-3P60369 221 aa5.39□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZRX8 168 aa5.39□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.39□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 TENM3Q9P273 2699 aa5.38□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 IGFL1Q6UW32 110 aa5.38□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01554Q52M75 96 aa5.38□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.38□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.38□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB135Q30KP9 77 aa5.37□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 CASC2Q6XLA1 102 aa5.37□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.37□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.36□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.35□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 HRES1P13985 223 aa5.35□□□□□ -1.55
VWA3B-220ENST00000495571 LELP1Q5T871 98 aa5.33□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 ANK2Q01484 3957 aa5.32□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 LYSTQ99698 3801 aa5.32□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.32□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1B0GW54 56 aa5.31□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 A0A096LNI7 61 aa5.3□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.3□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 PRLHP81277 87 aa5.3□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 SPRR1AP35321 89 aa5.29□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 CASC10Q5T4H9 136 aa5.29□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 K7EIL1 84 aa5.29□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 CSAG1Q6PB30 78 aa5.28□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZR54 194 aa5.28□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.28□□□□□ -1.56
VWA3B-220ENST00000495571 H0Y9J4 135 aa5.27□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.27□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 H3BPC8 53 aa5.26□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 RTL8CO15255 209 aa5.26□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.26□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.25□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 A8MWP4 228 aa5.25□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.25□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.24□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.23□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.22□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087X002 238 aa5.22□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.22□□□□□ -1.57
VWA3B-220ENST00000495571 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.21□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 REG3GQ6UW15 175 aa5.21□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.2□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.18□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.18□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.18□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.17□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 Q5W150 140 aa5.17□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 Q96NJ1 140 aa5.17□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.16□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.15□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.15□□□□□ -1.58
VWA3B-220ENST00000495571 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
VWA3B-220ENST00000495571 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.14□□□□□ -1.59
VWA3B-220ENST00000495571 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.14□□□□□ -1.59
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP10-11P60412 298 aa5.14□□□□□ -1.59
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.14□□□□□ -1.59
VWA3B-220ENST00000495571 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.13□□□□□ -1.59
VWA3B-220ENST00000495571 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms