RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-207ENST00000484547 LCE2CQ5TA81 110 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 LPAP08519 4548 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 NCR3O14931 201 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 PFN2P35080 140 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 REG3GQ6UW15 175 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A096LNI7 61 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.3□□□□□ -1.24
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RABGEF1-207ENST00000484547 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZQT0 140 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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RABGEF1-207ENST00000484547 KLKP1Q107X0 134 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZRP5 223 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-207ENST00000484547 C6orf99Q4VX62 202 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ERC2-IT1O76042 136 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-207ENST00000484547 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-207ENST00000484547 DSCR8Q96T75 97 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 MUC2Q02817 5179 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GW54 56 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 F8WDY8 70 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM236CP0DP71 79 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SYCNQ0VAF6 134 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZVQ6 151 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SPAG11BQ08648 103 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 DIRC1Q969H9 104 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1W2PNN7 141 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 H7BZZ5 65 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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RABGEF1-207ENST00000484547 Q5XG85 94 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGEF1-207ENST00000484547 C20orf197Q8N268 126 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 Q8NDZ9 215 aa7.15□□□□□ -1.27
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RABGEF1-207ENST00000484547 COX7BP24311 80 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-207ENST00000484547 M0R378 163 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 C10orf25Q5T742 122 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV7-43P04211 117 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-207ENST00000484547 NREPQ16612 68 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-207ENST00000484547 C4orf26Q17RF5 130 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-207ENST00000484547 F8WEM9 126 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-207ENST00000484547 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2BP63146 152 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 HRCT1Q6UXD1 115 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.97□□□□□ -1.29
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