RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.02□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 Q1RN00 199 aa6.02□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 LST1O00453 97 aa6.01□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 LINC00483Q53H64 154 aa6.01□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.01□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 COX6CP09669 75 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 ATXN8Q156A1 80 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 Q8N377 158 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 NCR3O14931 201 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 MT1HP80294 61 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 XP32Q5T750 250 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 MTURNQ8N3F0 131 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 CLEC2BQ92478 149 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 PRYO14603 147 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 SLC25A20O43772 301 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 ETDBQ3ZM63 59 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 Q9BRP9 147 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-206ENST00000474188 B5MCH6 92 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 C9JAW5 83 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 K7ERU9 68 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 SPINK1P00995 79 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 TRACP01848 142 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 TEN1Q86WV5 123 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 H3BT86 120 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 MOBPQ13875 183 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.94□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 H0YGX0 51 aa5.94□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 IGLV6-57P01721 117 aa5.94□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.92□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GX51 115 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.9□□□□□ -1.46
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 PCOTHQ58A44 107 aa5.89□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 J3QR89 54 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 C6orf99Q4VX62 202 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 Q6ZRX8 168 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 SSPOA2VEC9 5147 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 LINC00575Q6W349 94 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 C9orf92A6NGG3 77 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 USH2AO75445 5202 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-206ENST00000474188 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 VPS25Q9BRG1 176 aa5.83□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.83□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 DNAL4O96015 105 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.81□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 hADV29S1A0JD25 119 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 SPRR1BP22528 89 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 COX7BP24311 80 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 A0A0G2JQZ4 141 aa5.79□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.78□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
NISCH-206ENST00000474188 H3BQ85 93 aa5.77□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 SNCGO76070 127 aa5.77□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.75□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 ACYP1P07311 99 aa5.75□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 Q6ZQY7 126 aa5.75□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 SMIM29Q86T20 159 aa5.75□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 SIGMAR1Q99720 223 aa5.75□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 C1orf195Q5TG92 126 aa5.74□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.73□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 MT-ATP8P03928 68 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-206ENST00000474188 GHRHP01286 108 aa5.71□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 CCKP06307 115 aa5.71□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.7□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 SCGB1A1P11684 91 aa5.7□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 LIMD2Q9BT23 127 aa5.7□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 M0R2T5 61 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms