RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 COX8AP10176 69 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 VAMP3Q15836 100 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 SCGB1D1O95968 90 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 IGFL1Q6UW32 110 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 Q6JHZ5 121 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 CFC1BP0CG36 223 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 CFC1P0CG37 223 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 TCL1BO95988 128 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 CLEC2BQ92478 149 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 HIGD1BQ9P298 99 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H4GQ99525 98 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 C12orf57Q99622 126 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 Q6Q795 121 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 F8WEM9 126 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 C14orf144Q96I85 54 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0B4J2C4 111 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 PYY3Q5JQD4 70 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-232ENST00000470482 SPATA45Q537H7 98 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 H3BUT2 72 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 Q75L30 129 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 VAMP8Q9BV40 100 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 H0YGX0 51 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 Q96NJ1 140 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1B0GX51 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 CEND1Q8N111 149 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-232ENST00000470482 FXYD2P54710 66 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 TEN1Q86WV5 123 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 A8MUU9 505 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 LST1O00453 97 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 RAB37Q96AX2 223 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1W2PNM2 257 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 TRIAP1O43715 76 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 A0A087WSZ3 146 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 H3BMG7 143 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-232ENST00000470482 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 A6NJY4 79 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 SNCGO76070 127 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.99□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 GHRHP01286 108 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 FABP2P12104 132 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 HSD52Q0P140 79 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-232ENST00000470482 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 K7ERJ3 54 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 M0R2T5 61 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 H3BQ85 93 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 DSCR10P59022 87 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM6P0DI80 62 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 UBE2V1Q13404 147 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00313P59037 77 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 USH2AO75445 5202 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 TRACP01848 142 aa5.91□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 IGKV4-1P06312 121 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-232ENST00000470482 HRES1P13985 223 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 SSPOA2VEC9 5147 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 DNAL4O96015 105 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 CCKP06307 115 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 COX6CP09669 75 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 PSMB2P49721 201 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 SIGMAR1Q99720 223 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1B0GV72 72 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 MT2AP02795 61 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1B0GVX0 72 aa5.83□□□□□ -1.48
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.82□□□□□ -1.48
HDLBP-232ENST00000470482 TSTD3H0UI37 97 aa5.82□□□□□ -1.48
HDLBP-232ENST00000470482 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms