RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-209ENST00000470095 F8W1H4 67 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-209ENST00000470095 H3BQ85 93 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-209ENST00000470095 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-209ENST00000470095 SMIM29Q86T20 159 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-209ENST00000470095 GHRHP01286 108 aa8.52□□□□□ -1.05
HPS1-209ENST00000470095 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.52□□□□□ -1.05
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.51□□□□□ -1.05
HPS1-209ENST00000470095 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.5□□□□□ -1.05
HPS1-209ENST00000470095 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HPS1-209ENST00000470095 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.46□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 A0A1B0GV72 72 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 ETDBQ3ZM63 59 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 TEN1Q86WV5 123 aa8.45□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.44□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.43□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 A0A087X002 238 aa8.43□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 F8WEM9 126 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.42□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.41□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.41□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 MOBPQ13875 183 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.4□□□□□ -1.06
HPS1-209ENST00000470095 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.39□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 CRYGAP11844 174 aa8.39□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.39□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 Q8NBF4 154 aa8.39□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 A0A0G2JQZ4 141 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 IGFL1Q6UW32 110 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.37□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.36□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 Q6JHZ5 121 aa8.36□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 Q6ZQT0 140 aa8.35□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 DSCR8Q96T75 97 aa8.35□□□□□ -1.07
HPS1-209ENST00000470095 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.34□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 A0A1W2PNM2 257 aa8.32□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 PDE6GP18545 87 aa8.32□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 CCKP06307 115 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 Q6Q795 121 aa8.29□□□□□ -1.08
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP10-8P60410 259 aa8.27□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 VPS25Q9BRG1 176 aa8.27□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.26□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 MT1HL1P0DM35 61 aa8.25□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 CD164Q04900 197 aa8.25□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.25□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 OXTP01178 125 aa8.23□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.23□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.21□□□□□ -1.09
HPS1-209ENST00000470095 A0A087WSZ3 146 aa8.21□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.2□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 A0A1B0GW54 56 aa8.2□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 J3QR89 54 aa8.2□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 LINC00846Q9NV44 126 aa8.19□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 K7ERU9 68 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 SPINK1P00995 79 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 ACYP1P07311 99 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 Q5XG85 94 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 TNXBP22105 4242 aa8.15□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
HPS1-209ENST00000470095 HERC1Q15751 4861 aa8.13□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 Q6ZVQ6 151 aa8.13□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.13□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 MYCBP2O75592 4640 aa8.13□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 LIMD2Q9BT23 127 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 Q96NJ1 140 aa8.11□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 CDIP1Q9H305 208 aa8.11□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 NREPQ16612 68 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 UBL5Q9BZL1 73 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HPS1-209ENST00000470095 C1orf195Q5TG92 126 aa8.07□□□□□ -1.12
HPS1-209ENST00000470095 J3QL48 77 aa8.05□□□□□ -1.12
HPS1-209ENST00000470095 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.05□□□□□ -1.12
HPS1-209ENST00000470095 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.03□□□□□ -1.12
HPS1-209ENST00000470095 LINC00643Q86TS7 51 aa8.03□□□□□ -1.12
HPS1-209ENST00000470095 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 BPY2O14599 106 aa8.01□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 DSCR10P59022 87 aa8.01□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 SIGMAR1Q99720 223 aa8.01□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 IGKV4-1P06312 121 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.99□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 J3KT08 172 aa7.99□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.99□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 CXCL6P80162 114 aa7.98□□□□□ -1.13
HPS1-209ENST00000470095 A8MWP4 228 aa7.96□□□□□ -1.14
HPS1-209ENST00000470095 K7EQZ3 153 aa7.95□□□□□ -1.14
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