RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, human

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PREB-208	ENST00000468045	MP68	P56378	58 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PREB-208	ENST00000468045	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PREB-208	ENST00000468045	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PREB-208	ENST00000468045	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PREB-208	ENST00000468045	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045		H3BNG1	76 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	PRR15L	Q9BU68	103 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045		H0Y9P7	68 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	NDUFB1	O75438	58 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	MAST4	O15021	2626 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045		J3QKU1	62 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	CASC2	Q6XLA1	102 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045		A0A096LNI7	61 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	UBE2A	P49459	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	LCA10	Q71F78	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045		A6NED7	52 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PREB-208	ENST00000468045	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PREB-208	ENST00000468045	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PREB-208	ENST00000468045	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PREB-208	ENST00000468045	PCOTH	Q58A44	107 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PREB-208	ENST00000468045	LYST	Q99698	3801 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PREB-208	ENST00000468045		H0Y9J4	135 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	COA5	Q86WW8	74 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	LIMD2	Q9BT23	127 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045		A8MWP4	228 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045		A6NN06	94 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PREB-208	ENST00000468045	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PREB-208	ENST00000468045	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		11	□□□□□ -0.65
PREB-208	ENST00000468045	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PREB-208	ENST00000468045		H3BPC8	53 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PREB-208	ENST00000468045		Q75L30	129 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PREB-208	ENST00000468045	NDUFS5	O43920	106 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PREB-208	ENST00000468045	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.96	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		10.95	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		10.94	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	MOBP	Q13875	183 aa		10.93	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		10.91	□□□□□ -0.66
PREB-208	ENST00000468045	PRAC1	Q96KF2	57 aa		10.9	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		10.9	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		10.88	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045	SPINK7	P58062	85 aa		10.88	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045	C8orf87	E5RJ46	101 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045	SPRR1B	P22528	89 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045		Q96NJ1	140 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PREB-208	ENST00000468045	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	HRES1	P13985	223 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	PANO1	I0J062	215 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045		K7EIL1	84 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045		A0A087X002	238 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PREB-208	ENST00000468045	LINC00313	P59037	77 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045		Q6ZR54	194 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045		H3BS24	57 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PREB-208	ENST00000468045		A0A1B0GVX0	72 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PREB-208	ENST00000468045	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PREB-208	ENST00000468045	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		10.68	□□□□□ -0.7

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