RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP54-210ENST00000466048 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.1□□□□□ -1.59
USP54-210ENST00000466048 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.1□□□□□ -1.59
USP54-210ENST00000466048 NOTCH1P46531 2555 aa5.09□□□□□ -1.59
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USP54-210ENST00000466048 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.09□□□□□ -1.6
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USP54-210ENST00000466048 K7EQZ3 153 aa4.98□□□□□ -1.61
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USP54-210ENST00000466048 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.97□□□□□ -1.61
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USP54-210ENST00000466048 CUBNO60494 3623 aa4.95□□□□□ -1.62
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USP54-210ENST00000466048 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.9□□□□□ -1.63
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USP54-210ENST00000466048 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP54-210ENST00000466048 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.88□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP54-210ENST00000466048 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP54-210ENST00000466048 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 CRIPTQ9P021 101 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP54-210ENST00000466048 Q6ZR54 194 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP54-210ENST00000466048 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.85□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 IGLV7-43P04211 117 aa4.85□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.84□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 OXTP01178 125 aa4.84□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 SPRR4Q96PI1 79 aa4.84□□□□□ -1.63
USP54-210ENST00000466048 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.84□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 FAM168BA1KXE4 195 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 SPRR1AP35321 89 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 Q5VV11 94 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-210ENST00000466048 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.82□□□□□ -1.64
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