RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449271.5

BBX-214, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-214ENST00000449271 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 NPCDR1Q9BY65 106 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
BBX-214ENST00000449271 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa-0.02□□□□□ -2.41
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BBX-214ENST00000449271 BATF3Q9NR55 127 aa-0.02□□□□□ -2.41
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BBX-214ENST00000449271 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.02□□□□□ -2.41
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BBX-214ENST00000449271 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-0.03□□□□□ -2.41
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BBX-214ENST00000449271 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
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BBX-214ENST00000449271 J3KT08 172 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 K7ERS5 55 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 HPGDSO60760 199 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 PFDN1O60925 122 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 NPYP01303 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 CCKP06307 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 ACYP1P07311 99 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 G0S2P27469 103 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 GCHFRP30047 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 CKS2P33552 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
BBX-214ENST00000449271 PSMB2P49721 201 aa-0.04□□□□□ -2.42
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