RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	CFC1B	P0CG36	223 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	MT1H	P80294	61 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PCOTH	Q58A44	107 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP3	Q15836	100 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA45	Q537H7	98 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP8	Q9BV40	100 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	COX8A	P10176	69 aa		9.57	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	C14orf144	Q96I85	54 aa		9.56	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	hADV29S1	A0JD25	119 aa		9.55	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		9.54	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZQY7	126 aa		9.54	□□□□□ -0.88
MRPL28-203	ENST00000429738		F8WEM9	126 aa		9.52	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	DLEU1	O43261	78 aa		9.52	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TCL1B	O95988	128 aa		9.51	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6JHZ5	121 aa		9.5	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H4G	Q99525	98 aa		9.49	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf57	Q99622	126 aa		9.49	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	IGFL1	Q6UW32	110 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC2B	Q92478	149 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MRPL28-203	ENST00000429738	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MRPL28-203	ENST00000429738	HIGD1B	Q9P298	99 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MRPL28-203	ENST00000429738	CFC1	P0CG37	223 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM6	P0DI80	62 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MRPL28-203	ENST00000429738	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0B4J2C4	111 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R2T5	61 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BUT2	72 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB37	Q96AX2	223 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YGX0	51 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6Q795	121 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738	CEND1	Q8N111	149 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MRPL28-203	ENST00000429738	FXYD2	P54710	66 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	LST1	O00453	97 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	HSD52	Q0P140	79 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738		Q75L30	129 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	SNCG	O76070	127 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GX51	115 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	TEN1	Q86WV5	123 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MRPL28-203	ENST00000429738	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		9.27	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NJY4	79 aa		9.25	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		9.24	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		9.24	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BMG7	143 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738		K7ERJ3	54 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	GHRH	P01286	108 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738		Q96NJ1	140 aa		9.23	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WSZ3	146 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIAP1	O43715	76 aa		9.22	□□□□□ -0.93
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		9.21	□□□□□ -0.94
MRPL28-203	ENST00000429738	TSTD3	H0UI37	97 aa		9.2	□□□□□ -0.94
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP2	P12104	132 aa		9.2	□□□□□ -0.94
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PNM2	257 aa		9.18	□□□□□ -0.94
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MUU9	505 aa		9.18	□□□□□ -0.94
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R143	59 aa		9.13	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		9.12	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BQ85	93 aa		9.12	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAL4	O96015	105 aa		9.12	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		9.12	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	SSPO	A2VEC9	5147 aa		9.11	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	DSCR10	P59022	87 aa		9.1	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		9.1	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMB2	P49721	201 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPL28-203	ENST00000429738	USH2A	O75445	5202 aa		9.07	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	COX6C	P09669	75 aa		9.07	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	BATF	Q16520	125 aa		9.07	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGMAR1	Q99720	223 aa		9.07	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		9.06	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GV72	72 aa		9.05	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV4-1	P06312	121 aa		9.05	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00313	P59037	77 aa		9.04	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2V1	Q13404	147 aa		9.04	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		9.04	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
MRPL28-203	ENST00000429738	CCK	P06307	115 aa		9.02	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		9.02	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAC	P01848	142 aa		9.01	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		9.01	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		8.99	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		8.99	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		8.98	□□□□□ -0.97
MRPL28-203	ENST00000429738	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	8.95	□□□□□ -0.98

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