RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 MUC2Q02817 5179 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BT86 120 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 J3QR89 54 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF861PO60384 105 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 C6orf99Q4VX62 202 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 MTURNQ8N3F0 131 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCE1O60756 84 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 ETDBQ3ZM63 59 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7ERU9 68 aa6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.46□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.46□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEN1Q86WV5 123 aa6.46□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BQ85 93 aa6.45□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX7BP24311 80 aa6.45□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.45□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 hADV29S1A0JD25 119 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00575Q6W349 94 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.44□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.42□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0A0MQY5 61 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPRR1AP35321 89 aa6.4□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2AP49459 152 aa6.4□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRLHP81277 87 aa6.4□□□□□ -1.38
APOBEC3C-202ENST00000428892 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.38□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.38□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087X002 238 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 XP32Q5T750 250 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZQY7 126 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZRX8 168 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 VPS25Q9BRG1 176 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRYGAP11844 174 aa6.33□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACYP1P07311 99 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPRR4Q96PI1 79 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.31□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q9BRP9 147 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDE6GP18545 87 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSCR8Q96T75 97 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERC2-IT1O76042 136 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00483Q53H64 154 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 MUC17Q685J3 4493 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GV72 72 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCKP06307 115 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 TPRXLQ17RH7 258 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIGMAR1Q99720 223 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8WEM9 126 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8N377 158 aa6.24□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.22□□□□□ -1.41
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZQT0 140 aa6.21□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.2□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPRR1BP22528 89 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00643Q86TS7 51 aa6.19□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8NBF4 154 aa6.18□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBL5Q9BZL1 73 aa6.17□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GW54 56 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 MOBPQ13875 183 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.16□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6JHZ5 121 aa6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00846Q9NV44 126 aa6.15□□□□□ -1.42
APOBEC3C-202ENST00000428892 MT-ATP8P03928 68 aa6.14□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM29Q86T20 159 aa6.14□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.14□□□□□ -1.43
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPINK1P00995 79 aa6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms