RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 B5MCH6 92 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 F8W1H4 67 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 COX7BP24311 80 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 hADV29S1A0JD25 119 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 H3BMG7 143 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 GHRHP01286 108 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZRX8 168 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 SLC25A20O43772 301 aa6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 CLEC2BQ92478 149 aa6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 VPS25Q9BRG1 176 aa6.02□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 PRO0461Q9UI25 63 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 MUC2Q02817 5179 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 H3BT86 120 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 C3orf22Q8N5N4 141 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 HIGD2AQ9BW72 106 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 DNAL4O96015 105 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 Q9BRP9 147 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 C9JAW5 83 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.97□□□□□ -1.45
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 ERC2-IT1O76042 136 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 CRYGAP11844 174 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 SPRR4Q96PI1 79 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 SPRR1BP22528 89 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZQY7 126 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 J3QR89 54 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 SCGB1A1P11684 91 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 PRR4Q16378 134 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 TEN1Q86WV5 123 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 Q8N377 158 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.91□□□□□ -1.46
HDLBP-216ENST00000428482 ETDBQ3ZM63 59 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00483Q53H64 154 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM29Q86T20 159 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 PDE6GP18545 87 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 MOBPQ13875 183 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 MTURNQ8N3F0 131 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 Q8NBF4 154 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 SIGMAR1Q99720 223 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GW54 56 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.83□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GV72 72 aa5.82□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 CCKP06307 115 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 Q6JHZ5 121 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 DSCR8Q96T75 97 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 ACYP1P07311 99 aa5.8□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZQT0 140 aa5.8□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.8□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.79□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 F8WEM9 126 aa5.79□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 Q6Q795 121 aa5.79□□□□□ -1.48
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 A0A0G2JQZ4 141 aa5.76□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 TPRXLQ17RH7 258 aa5.76□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 CD164Q04900 197 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 IGFL1Q6UW32 110 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1W2PNM2 257 aa5.73□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.73□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.72□□□□□ -1.49
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.71□□□□□ -1.5
HDLBP-216ENST00000428482 CDIP1Q9H305 208 aa5.71□□□□□ -1.5
HDLBP-216ENST00000428482 SPINK1P00995 79 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-216ENST00000428482 Q5XG85 94 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-216ENST00000428482 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-216ENST00000428482 SVIPQ8NHG7 77 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms