RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.65□□□□□ -0.54
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JQZ4 141 aa11.64□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PNN7 141 aa11.64□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 V9GYY9 64 aa11.64□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PSCAO43653 123 aa11.63□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR4Q16378 134 aa11.63□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR15Q8IV56 129 aa11.63□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.62□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.61□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PSPHP1O15172 72 aa11.6□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 LYSTQ99698 3801 aa11.6□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.6□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 REG3GQ6UW15 175 aa11.59□□□□□ -0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.58□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFB1O75438 58 aa11.57□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 IGFL1Q6UW32 110 aa11.57□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.57□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.54□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MP68P56378 58 aa11.54□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PRLHP81277 87 aa11.54□□□□□ -0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087WSZ3 146 aa11.5□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.5□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00208Q96KT6 92 aa11.5□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC61GP60059 68 aa11.5□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 B9D2Q9BPU9 175 aa11.49□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A096LNI7 61 aa11.49□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MUN3 132 aa11.49□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.48□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CSMD3Q7Z407 3707 aa11.48□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DNHD1Q96M86 4753 aa11.47□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PMAIP1Q13794 54 aa11.47□□□□□ -0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 H0Y9P7 68 aa11.44□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa11.43□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.43□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 TENM2Q9NT68 2774 aa11.43□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 Q5VV11 94 aa11.42□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.42□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 CASC2Q6XLA1 102 aa11.42□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf90A8MZG2 172 aa11.41□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BPC8 53 aa11.41□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2AP49459 152 aa11.39□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.39□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MU10 97 aa11.38□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CHTF8P0CG12 524 aa11.36□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MWP4 228 aa11.35□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.35□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LIMD2Q9BT23 127 aa11.34□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.34□□□□□ -0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.33□□□□□ -0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.32□□□□□ -0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 APLNQ9ULZ1 77 aa11.31□□□□□ -0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.3□□□□□ -0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR15LQ9BU68 103 aa11.3□□□□□ -0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRR1BP22528 89 aa11.28□□□□□ -0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.25□□□□□ -0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 COA5Q86WW8 74 aa11.25□□□□□ -0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.25□□□□□ -0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 H0Y9J4 135 aa11.24□□□□□ -0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.24□□□□□ -0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 Q75L30 129 aa11.21□□□□□ -0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.2□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.19□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 LCA10Q71F78 164 aa11.19□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PANO1I0J062 215 aa11.18□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 C14orf177Q52M58 125 aa11.17□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PCOTHQ58A44 107 aa11.17□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 A6NED7 52 aa11.15□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.15□□□□□ -0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CD164Q04900 197 aa11.14□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 NUPR2A6NF83 97 aa11.14□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.13□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.13□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KMT2AQ03164 3969 aa11.13□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 Q96NJ1 140 aa11.12□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.12□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.11□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.11□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.11□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 FBN3Q75N90 2809 aa11.09□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.09□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 MOBPQ13875 183 aa11.09□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZR54 194 aa11.09□□□□□ -0.63
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.08□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.07□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa11.07□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.07□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.06□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAH2Q9P225 4427 aa11.06□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TGP01266 2768 aa11.06□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 A6NN06 94 aa11.05□□□□□ -0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms