RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.13□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.13□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM29Q86T20 159 aa10.12□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAT1Q14517 4588 aa10.11□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.11□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8WEM9 126 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf22Q8N5N4 141 aa10.1□□□□□ -0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYGAP11844 174 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.07□□□□□ -0.8
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TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087X002 238 aa10.04□□□□□ -0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.04□□□□□ -0.8
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.02□□□□□ -0.8
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.95□□□□□ -0.82
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-8P60410 259 aa9.91□□□□□ -0.82
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CD164Q04900 197 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PNM2 257 aa9.87□□□□□ -0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.87□□□□□ -0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.87□□□□□ -0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS25Q9BRG1 176 aa9.85□□□□□ -0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINK1P00995 79 aa9.83□□□□□ -0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1HL1P0DM35 61 aa9.83□□□□□ -0.84
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TOP3BP1-201ENST00000420768 J3QR89 54 aa9.78□□□□□ -0.84
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LIMD2Q9BT23 127 aa9.77□□□□□ -0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.77□□□□□ -0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q5XG85 94 aa9.76□□□□□ -0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.75□□□□□ -0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACYP1P07311 99 aa9.75□□□□□ -0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 J3QL48 77 aa9.74□□□□□ -0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ERU9 68 aa9.71□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.71□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYCBP2O75592 4640 aa9.71□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.7□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00846Q9NV44 126 aa9.7□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.69□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 NREPQ16612 68 aa9.68□□□□□ -0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBL5Q9BZL1 73 aa9.68□□□□□ -0.86
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.63□□□□□ -0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf195Q5TG92 126 aa9.62□□□□□ -0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q96NJ1 140 aa9.62□□□□□ -0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 J3KT08 172 aa9.6□□□□□ -0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV4-1P06312 121 aa9.56□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGMAR1Q99720 223 aa9.56□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPY2O14599 106 aa9.55□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.55□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.55□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.54□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00643Q86TS7 51 aa9.54□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.53□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDIP1Q9H305 208 aa9.53□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCL6P80162 114 aa9.52□□□□□ -0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MWP4 228 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFB1O75438 58 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 DSCR10P59022 87 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.45□□□□□ -0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR4Q16378 134 aa9.45□□□□□ -0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.44□□□□□ -0.9
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