RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.92□□□□□ -0.34
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATXN8Q156A1 80 aa12.91□□□□□ -0.34
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMIM29Q86T20 159 aa12.91□□□□□ -0.34
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.91□□□□□ -0.34
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MT1HL1P0DM35 61 aa12.9□□□□□ -0.34
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FABP2P12104 132 aa12.89□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.89□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.88□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.88□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.88□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.87□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.87□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GHRHP01286 108 aa12.86□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MOBPQ13875 183 aa12.84□□□□□ -0.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 J3QL48 77 aa12.83□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.82□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPCS1Q9Y6A9 102 aa12.82□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 H3BQ85 93 aa12.8□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa12.79□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q8NBF4 154 aa12.79□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.79□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 F8WEM9 126 aa12.78□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 H3BMG7 143 aa12.78□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.77□□□□□ -0.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C9JAW5 83 aa12.75□□□□□ -0.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 K7EP34 96 aa12.74□□□□□ -0.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa12.73□□□□□ -0.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 UBE2V1Q13404 147 aa12.73□□□□□ -0.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.72□□□□□ -0.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.69□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A0G2JQZ4 141 aa12.68□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MTURNQ8N3F0 131 aa12.68□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q6JHZ5 121 aa12.67□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa12.67□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.66□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGFL1Q6UW32 110 aa12.66□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A1B0GV72 72 aa12.65□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 H3BT86 120 aa12.65□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPAG11AQ6PDA7 123 aa12.65□□□□□ -0.38
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HRCT1Q6UXD1 115 aa12.62□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HERC1Q15751 4861 aa12.61□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPINK1P00995 79 aa12.61□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRO0461Q9UI25 63 aa12.61□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CD164Q04900 197 aa12.6□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A1B0GV90 55 aa12.57□□□□□ -0.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.57□□□□□ -0.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.54□□□□□ -0.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RPS29P62273 56 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa12.54□□□□□ -0.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DSCR8Q96T75 97 aa12.54□□□□□ -0.4
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q6Q795 121 aa12.52□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A1W2PNM2 257 aa12.51□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 F8W1H4 67 aa12.51□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TEN1Q86WV5 123 aa12.51□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa12.5□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.48□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCKP06307 115 aa12.47□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LIMD2Q9BT23 127 aa12.47□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.46□□□□□ -0.41
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q5XG85 94 aa12.45□□□□□ -0.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q6ZQT0 140 aa12.45□□□□□ -0.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 VPS25Q9BRG1 176 aa12.44□□□□□ -0.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PDE6GP18545 87 aa12.43□□□□□ -0.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RETNLBQ9BQ08 111 aa12.43□□□□□ -0.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A087WSZ3 146 aa12.41□□□□□ -0.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HMCN2Q8NDA2 5059 aa12.39□□□□□ -0.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ETDBQ3ZM63 59 aa12.38□□□□□ -0.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa12.36□□□□□ -0.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.36□□□□□ -0.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.35□□□□□ -0.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRR4Q16378 134 aa12.33□□□□□ -0.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C1orf195Q5TG92 126 aa12.33□□□□□ -0.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A1B0GW54 56 aa12.31□□□□□ -0.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa12.26□□□□□ -0.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q96NJ1 140 aa12.25□□□□□ -0.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LINC00472Q9H8W2 130 aa12.21□□□□□ -0.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LPAP08519 4548 aa12.17□□□□□ -0.46
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DEFB116Q30KQ4 102 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NREPQ16612 68 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGKV4-1P06312 121 aa12.13□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TPRXLQ17RH7 258 aa12.13□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa12.12□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LINC00846Q9NV44 126 aa12.11□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIGMAR1Q99720 223 aa12.11□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LRP2P98164 4655 aa12.1□□□□□ -0.47
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 Q6ZVQ6 151 aa12.08□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 J3KT08 172 aa12.07□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C9orf92A6NGG3 77 aa12.04□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 UBL5Q9BZL1 73 aa12.04□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ACYP1P07311 99 aa12.03□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.03□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDIP1Q9H305 208 aa12.03□□□□□ -0.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BPY2O14599 106 aa11.98□□□□□ -0.49
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A8MWP4 228 aa11.97□□□□□ -0.49
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DSCR10P59022 87 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms