RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A096LNT2 108 aa6.8□□□□□ -1.32
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SH3BP2-201ENST00000356331 Q8N1X5 172 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP2-201ENST00000356331 CSAG1Q6PB30 78 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP2-201ENST00000356331 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP2-201ENST00000356331 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP2-201ENST00000356331 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.77□□□□□ -1.33
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SH3BP2-201ENST00000356331 J3QL48 77 aa6.76□□□□□ -1.33
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SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF292O60281 2723 aa6.73□□□□□ -1.33
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SH3BP2-201ENST00000356331 A6NN06 94 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP2-201ENST00000356331 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.42□□□□□ -1.38
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SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFAF8A1L188 74 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP2-201ENST00000356331 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP2-201ENST00000356331 ZZEF1O43149 2961 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP2-201ENST00000356331 COL6A3P12111 3177 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-201ENST00000356331 HIVEP1P15822 2718 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP2-201ENST00000356331 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.19□□□□□ -1.42
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SH3BP2-201ENST00000356331 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.19□□□□□ -1.42
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