RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 X6R8D5 127 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 H3BQ85 93 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 A0A087X002 238 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 LINC00575Q6W349 94 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 Q8NAQ8 132 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.76□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.75□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 C10orf25Q5T742 122 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 PKD1P98161 4303 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 H3BNG1 76 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 LY6G6CO95867 125 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 COX7BP24311 80 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 SPINK7P58062 85 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-202ENST00000349984 HTN3P15516 51 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 RTL8CO15255 209 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 Q6ZQY7 126 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 DEFB130BP0DP73 79 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 DEFB130AP0DP74 79 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 A0A1W2PNM2 257 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 INSP01308 110 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 COA5Q86WW8 74 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 NUPR2A6NF83 97 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 APLNQ9ULZ1 77 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 SPAG11BQ08648 103 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 REG3AQ06141 175 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 KLK12Q9UKR0 248 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 CSAG1Q6PB30 78 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 Q8NDZ9 215 aa4.65□□□□□ -1.66
CCR6-202ENST00000349984 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.65□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 ROMO1P60602 79 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 Q8IZM0 81 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 Q6ZR54 194 aa4.64□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 H3BPC8 53 aa4.62□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.62□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 A0A096LPF7 62 aa4.62□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.62□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.62□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.61□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 COX17Q14061 63 aa4.61□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.6□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GW54 56 aa4.6□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 H0Y9P7 68 aa4.6□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 C16orf74Q96GX8 76 aa4.6□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 HERC2O95714 4834 aa4.6□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.59□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.59□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.59□□□□□ -1.67
CCR6-202ENST00000349984 IGLV6-57P01721 117 aa4.59□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 DSCR10P59022 87 aa4.59□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 K7EQZ3 153 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 HSPG2P98160 4391 aa4.58□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 RYR1P21817 5038 aa4.57□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.56□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.55□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GUV1 79 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 GYPEP15421 78 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.54□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 TNP2Q05952 138 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 REG3GQ6UW15 175 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-202ENST00000349984 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GVY2 172 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms